Madagaskarin Paster-instituuttia on syyskuusta 2021 lähtien johtanut mikrobiologi, tohtori Philippe Dussart. Hän seuraa tehtävässä tohtori André Spiegeliä.[2][3]
Instituutin historia alkaa vuodesta 1898, jolloin Madagaskariin perustettiin rokotetutkimuslaitos Institut vaccinogène et antirabique de Tananarive. Tutkimuslaitos vihittiin vuonna 1900, jolloin virallisessa lehdessä sitä luonnehdittiin nimellä Institut Pasteur de Tananarive. Virallisesti laitoksesta tuli osa Pasteur-instituuttien verkostoa vuonna 1927, jolloin tutkimuslaitoksen nimeksi vaihdettiin nykyinen Institut Pasteur de Madagascar. Tutkimuslaitoksen asemaa ja roolia koskeva yhteistyösopimus solmittiin vuonna 1961 Pariisin Pasteur-instituutin ja Madagaskarin terveysministeriön välillä.[1][4]