Fukagawan nimi (’syväjoki’) lienee käännös ainun kielen sanasta memu, jolla on samantyyppinen merkitys. Japanilaisten uudisasutus alueella alkoi 1890-luvulla. 1900-luvun alkupuolella alueelle rakennettiin kastelukanavia, joiden ansiosta siellä voitiin viljellä riisiä. Sen lisäksi Fukagawassa tuotetaan vihanneksia ja hedelmiä, kuten omenoita ja kirsikoita, ja harjoitetaan karjataloutta. Kaupunkioikeudet Fukagawalle myönnettiin vuonna 1963, kun Fukagawan maaseutukaupunkiin liitettiin kolme kyläkuntaa. Kaupunkiin on sijoittunut elintarviketeollisuutta ja maatalouskoneiden tuotantoa.[4][1][5]