Burkhalter oli kotikantoninsa Neuchâtelin parlamentin jäsen 1990–2001 ja synnyinkaupunkinsa kaupunginhallituksen jäsen 1991–2005. Vuonna 2003 hänet valittiin Sveitsin kansallisneuvostoon ja 2007 liittokokouksen jäseneksi.[2]
Vuonna 2014 Burkhalter oli Etyjin puheenjohtaja.[3]
Ekonomin koulutuksen saanut Burkhalter on naimisissa ja hänellä on kolme lasta.