Las montañas Bogda Shan se extienden de oeste a este una distancia de unos 300 km, separando la depresión de Turfán (sur) de Zungaria (norte). Administrativamente, la cordillera forma la frontera entre el distrito Dabancheng, hacia el sur, y la ciudad de Fukang y el condado de Jimsar, al norte. En las tres unidades, la agricultura de regadío se basa en el agua que fluye de los ríos y arroyos que comienzan en las Shan Bogda.
La cordillera tiene laderas empinadas y en sus cimas se encuentran glaciares y nieves eternas. En el cinturón medio crecen bosques de coníferas, arbustos y prados alpinos. En la parte baja hay desiertos y paisajes esteparios. En la vertiente noroeste del pico Bogda Ula está el lago Tyanchi, un lago de alta montaña llamado «la perla del Tien Shan».