Ĝi estis ŝlosila institucio en alteduko por nigrulaj afrikanoj de 1916 ĝis 1959. Ĝi ofertis akademie okcidentstilan edukon al studentoj de ĉie en subsahara Afriko. Liaj studentoj estis parto de sendependecmovadoj kaj postaj registaroj de afrikaj landoj. Inter liaj plej elstaraj iamaj studentoj oni trovas Nelson Mandela, Oliver Tambo, Steve Biko, Mangosuthu Buthelezi, Chris Hani, Joshua Nkomo, Julius Nyerere, Kenneth Kaunda kaj Robert Mugabe.
En 1959 la universitato estis inkludita sub rasapartismo, sed nun estas parto de la post-rasapartisma sudafrika eduka sistemo. La ĉefkampuso de la universitato estas plej proksime al la Rivero Tyhume kiam ĝi pasas tra la urbo de Alice (aŭ Dikeni, en la kosa).
Fort Beaufort servas kiel eta 'dormurbo' por akademiaj stabanaro kaj studentoj de la universitato