En la 16-a jarcento la reformacio ankaŭ en Győr disetendiĝis, la unuaj protestantoj estis soldatoj de la fortikaĵo. Ili estis majoritate germanoj, minoritate hungaroj. La Baziliko-katedralo de Győr restis katolika, sed la paroĥan kirkon akiris la protestantoj. Post mallonga turka dominado la jezuitoj regis en la urbo. En 1613 nur en la urborando povis esti protestanta kirko, sed ankaŭ tio ĉesis en 1633. La protestantoj disiĝis en 1647 al kalvinanoj kaj luteranoj. En 1783 la urbo deklaris la liberan religiuzon. En la sekva jaro la kalvinanoj aĉetis domon, kiun ili malkonstruis kaj konstruis propran kalvinanan preĝejon. Ĝi funkciis ĝis 1906. La nun videbla, jam impona preĝejo estis konstruita en 1905.
