Deggendorf per individua motora trafiko konektiĝas al la aŭtovojo, al la federacia vojo kaj estas la finpunkto de la aŭtovojo venanta el Munkeno, kaj kompreneble ankaŭ havas fervojan stacidomon.
La urbo situas borde de la rivero Danubo, kaj en la urba teritorio, 4 kilometrojn sude de la urbocentro kaj laŭ la danuba fluo iom post la paso de la centro, en la Danubon enfluas la rivero Isar.
