Το λήμμα παραθέτει τις πηγές του αόριστα, χωρίς παραπομπές. Βοηθήστε συνδέοντας το κείμενο με τις πηγές χρησιμοποιώντας παραπομπές, ώστε να είναι επαληθεύσιμο. Η σήμανση τοποθετήθηκε στις 14/02/2020.

Το πρωτάθλημα Α1΄ Εθνικής κατηγορίας χάντμπολ ανδρών της περιόδου 1999–2000 ήταν το ενδέκατο από την καθιέρωση της Α1 και συνολικά το 23ο πρωτάθλημα Ελλάδος στην ιστορία του χάντμπολ (μαζί με τα δυο πρωταθλήματα που είχε διοργανώσει ο ΣΕΓΑΣ).

Πρωταθλητής αναδείχθηκε, για πρώτη φορά στην ιστορία του θεσμού, ο Πανελλήνιος Γ.Σ.. Επικράτησε στους τελικούς των πλέι-οφ του Γ.Α.Σ. Κιλκίς με 2-0 νίκες. Ο σύλλογος της Κυψέλης πέτυχε το νταμπλ καθώς αναδείχθηκε και Κυπελλούχος Ελλάδος.

Στην κανονική περίοδο οι ομάδες αγωνίστηκαν σε δύο γύρους. Οι τέσσερις πρώτες ομάδες προκρίθηκαν στη διαδικασία των πλέι οφ, και οι τέσσερις τελευταίες συνέχισαν στα πλέι άουτ.^[1]

Οι σειρές κρίθηκαν με βάση τους βαθμούς, και την πρόκριση κέρδιζε η ομάδα που συμπλήρωνε πρώτη τουλάχιστον τρεις βαθμούς.

• 6/5/2000: Βριλήσσια–Φοίβος Συκεών 26–23
• 6/5/2000: Αθηναϊκός–ΓΕ Βέροιας 24–21
• 13/5/2000: Φοίβος Συκεών–Βριλήσσια 17–22
• 13/5/2000: ΓΕ Βέροιας–Αθηναϊκός 22–30

• 5/5/2000: Πανελλήνιος–ΑΣΕ Δούκα 20–21
• 6/5/2000: Κιλκίς–Αρχέλαος 27–23
• 12/5/2000: ΑΣΕ Δούκα–Πανελλήνιος 22–25
• 12/5/2000: Αρχέλαος–Κιλκίς 22–21
• 17/5/2000: Πανελλήνιος–ΑΣΕ Δούκα 27–21
• 17/5/2000: Κιλκίς–Αρχέλαος 25–19

• 20/5/2000: ΑΣΕ Δούκα–Αρχέλαος 33–26
• 27/5/2000: Αρχέλαος–ΑΣΕ Δούκα 24–25

• 19/5/2000, Κιλκίς: Κιλκίς–Πανελλήνιος 23–25
• 26/5/2000, Κυψέλη: Πανελλήνιος–Κιλκίς 22–18

• Στο Κύπελλο Κυπελλούχων αγωνίστηκε ο Αρχέλαος Κατερίνης ως φιναλίστ του Κυπέλλου Ελλάδος.

Α1΄ χάντμπολ ανδρών Πρωταθλητής 1999-2000
Πανελλήνιος Γ.Σ. 1ος τίτλος

• Ματιές στα σπορ, Ιανουάριος 2001 σελ. 78-79.