Η Μυρτοποταμιά ανήκει στην Κοινότητα Λυκότραφου, υπάγεται στη Δημοτική Ενότητα Μεσσήνης, του Δήμου Μεσσήνης και βρίσκεται σε υψόμετρο 71 μέτρων.[3] Μέχρι το 1927 ονομαζόταν Μισυρλί, ή Μισερλί και μέχρι το 1940 Μικροποταμιά.[4]
Διοικητικές μεταβολές
25-07-1879, ο οικισμός Μισυρλί, ή Μισερλί προσαρτάται στο Δήμο Εύας.
31-08-1912, ο οικισμός Μισυρλί, ή Μισερλί αποσπάται από το Δήμο Εύας και προσαρτάται στην Κοινότητα Βρωμόβρυσης (Αμφιθέας).
26-03-1919, ο οικισμός Μισυρλί, ή Μισερλί αποσπάται από την Κοινότητα Βρωμόβρυσης και ορίζεται έδρα της Κοινότητας Μισυρλίου ή Μισερλίου.[5]
15-09-1926, ο οικισμός Μισυρλί, ή Μισερλί παύει να είναι έδρα της κοινότητας Σπηταλίων. Η έδρα της Κοινότητας μεταφέρεται από τον οικισμό Μισυρλί ή Μισερλί στον οικισμό Σπητάλια. Η κοινότητα μετονομάζεται σε κοινότητα Σπηταλίων.
29-09-1927, ο οικισμός Μισυρλί, ή Μισερλί αποσπάται από την Κοινότητα Σπηταλίων (Σπιταλίου) και προσαρτάται στην Κοινότητα Πηλαλίστρας.
22-12-1927, ο οικισμός Μισυρλί, ή Μισερλί μετονομάζεται σε Μικροποταμιά.
10-05-1973, ο οικισμός Μυρτοποταμιά[6] αποσπάται από την Κοινότητα Πιλαλίστρας και προσαρτάται στην Κοινότητα Λυκοτράφου.
04-12-1997, ο οικισμός Μυρτοποταμιά αποσπάται από την Κοινότητα Λυκοτράφου και προσαρτάται στο Δήμο Μεσσήνης.