Η πρωταθλήτρια της Α΄ κατηγορίας της Ε.Π.Σ. Μεσσηνίας κερδίζει την άνοδο στη Γ΄ Εθνική ερασιτεχνική κατηγορία. Η ομάδα που ανακηρύσσεται κυπελλούχος Ε.Π.Σ. Μεσσηνίας, αποκτά το δικαίωμα συμμετοχής στο Κύπελλο Ελλάδας της επόμενης περιόδου.
Η δομή του πρωταθλήματος της Ε.Π.Σ. Μεσσηνίας είναι η εξής:[1]
Α΄ Κατηγορία
Α1 Κατηγορία
Β΄ Κατηγορία (3 Όμιλοι)
Τα πρωταθλήματα διεκόπησαν αναπάντεχα λόγω της πανδημίας του κορονοϊού. Έτσι αποφασίστηκε η επικύρωση των βαθμολογιών του πρωταθλήματος όπως διαμορφώθηκαν μέχρι τη διακοπή τους.[2]
Πρωταθλητής της Α΄ Κατηγορίας Ε.Π.Σ. Μεσσηνίας αναδείχθηκε ο Πάμισος Μεσσήνης και προβιβάζεται στην Γ΄ Εθνική ερασιτεχνική κατηγορία.[2] Πρωταθλητής της Α1 Κατηγορίας αναδείχθηκε η Ομόνοια Καλαμάτας και προβιβάζεται μαζί με τους Απόλλων Πεταλιδίου και Παπαφλέσσα Χώρας.[2] Πρωταθλητές της Β΄ Κατηγορίας αναδείχθηκαν οι Αναγέννηση Παραλίας Καλαμάτας, Π.Α.Σ. Ράχη και Α.Ε. Λογγάς οι οποίοι και προβιβάζονται.[2]
Επίσης αποφασίστηκε να μην υποβιβαστεί κανένα σωματείο από καμία κατηγορία των πρωταθλημάτων της Ε.Π.Σ. Μεσσηνίας.[2]