Er gewann in seiner Karriere fünf ATP-Turniere: 1999 in Amsterdam, 2001 in Bukarest und 2002 in Casablanca, Doha und München. Bei 11 weiteren Turnieren erreichte er das Finale. Seine größten Erfolge bei Grand-Slam-Turnieren gelangen ihm bei den Australian Open und den US Open, wo er jeweils zweimal ins Viertelfinale einziehen konnte.
2003 unterlag El Aynaoui im Viertelfinale der Australian Open in einem engen Fünfsatzmatch Andy Roddick mit 19:21 im letzten Satz. Es war der längste Entscheidungssatz in der Geschichte der Grand-Slam-Turniere bis zur Erstrundenbegegnung zwischen John Isner und Nicolas Mahut in Wimbledon im Jahr 2010.
Am 3. Dezember 2005 wurde El Aynaoui bei einem Turnier in Italien positiv auf Cannabis getestet.
Ab 2006 spielte er in der deutschen Bundesliga für den Erfurter TC Rot-Weiß.
El Aynaoui, der zu den populärsten Personen des Landes gehört, wurde von Marokkos König mit den höchsten Auszeichnungen geehrt.
Zeichenerklärung: S = Turniersieg; F, HF, VF, AF = Einzug ins Finale / Halbfinale / Viertelfinale / Achtelfinale; 1, 2, 3 = Ausscheiden in der 1. / 2. / 3. Hauptrunde; Q1, Q2, Q3 = Ausscheiden in der 1. / 2. / 3. Runde der Qualifikation; n. a. = nicht ausgetragen
.svg){kind=small}
