Thomas Thacher besuchte die öffentlichen Schulen seiner Heimat und danach bis 1878 die Adams Academy in Quincy. Daran schloss sich bis 1882 ein Studium an der Harvard University an. Danach arbeitete er in Boston in der Wollindustrie. Außerdem wurde er Präsident der landwirtschaftlichen Vereinigung im Barnstable County und der Cape Cod Pilgrim Memorial Association. Überdies war er Vorsitzender der Planungskommission der Gemeinde Yarmouth Port. Politisch wurde er Mitglied der Demokratischen Partei.
Nach dem Ende seiner Zeit im US-Repräsentantenhaus nahm Thomas Thacher seine früheren Tätigkeiten wieder auf. Außerdem verfasste er Abhandlungen über wirtschaftliche Themen. Er starb am 11. April 1945 in Boston und wurde in seinem Heimatort Yarmouth Port beigesetzt.