Sarkviridae

Sarkviridae

Schemazeichnung: Salmonella-Phage Jersey,
Gattung Jerseyvirus (Querschnitt & Seitenansicht)

Systematik
Klassifikation: Viren
Realm: Duplodnaviria
Reich: Heunggongvirae
Phylum: Uroviricota
Klasse: Caudoviricetes
Ordnung: incertae sedis
Familie: Sarkviridae
Taxonomische Merkmale
Genom: dsDNA linear
Baltimore: Gruppe 1
Symmetrie: ikosaedrisch, tailed
(Siphoviren)
Hülle: keine
Wissenschaftlicher Name
Sarkviridae
Links

Sarkviridae ist eine im März 2025 als Familie eingerichtete Gruppe von Viren mit Kopf-Schwanz-Aufbau vom Morphotyp B (Siphoviren). Ihre Wirte sind Bakterien, was sie als Bakteriophagen klassifiziert.[1][2]

Beschreibung

Genomische, proteomische und phylogenetische Daten zeigten, dass es sich bei dieser Gruppe von Phagen um eine Verwandtschaftsgruppe (Klade) im Rang einer Familie handelt, zu der insbesondere die bereits zuvor eingerichtete Unterfamilie Guernseyvirinae gehört, nicht aber die Gattung Otakuvirus[3] (und ebenso Seretavirus).

Systematik

Die Systematik der Sarkviridae ist nach International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) (MSL#41v1, 20. März 2026), ergänzt um einige Vorschläge nach der Taxonomie des National Center for Biotechnology Information (NCBI) in Hochkommata mit Stand 25. Mai 2026 wie folgt:[4][5]

Familie Sarkviridae (Jersey-like siphophages)

  • Unterfamilie Guernseyvirinae (ursprünglich als Jerseyvirinae vorgeschlagen,[6] 3 Gattungen)
    • Gattung Cornellvirus (früher Sp31virus, Sp3unalikevirus; 9 Spezies)
      • Spezies Cornellvirus GRNsp27, mit Salmonella-Phage GRNsp27
      • Spezies Cornellvirus SE1, mit Salmonella-Phage vB_SenS_SE1
      • Spezies Cornellvirus SenTO17, mit Salmonella-Phage vB_SenTO17
      • Spezies Cornellvirus shemara, mit Salmonella-Phage Shemara
      • Spezies Cornellvirus SP31 (Salmonella-Virus SP31), mit Salmonella-Phage FSL SP-031
      • Spezies Cornellvirus St162, mit Salmonella-Phage St162
      • Spezies Cornellvirus TS6, mit Salmonella-Phage TS6
      • Spezies Cornellvirus VSiP Salmonella virus VSiP
      • Spezies Cornellvirus ZS, mit Salmonella-Phage vB_STM-ZS
    • Gattung Jerseyvirus (früher Jerseylikevirus; 64 ICTV-bestätigte Spezies)[7]
      • Spezies Jerseyvirus blauehaus, mit Salmonella-Phage blauehaus
      • Spezies Jerseyvirus celemicas, mit Salmonella-Phage celemicas
      • Spezies Jerseyvirus demigod, mit Salmonella-Phage demigod
      • Spezies Jerseyvirus dunkel, mit Salmonella-Phage dunkel
      • Spezies Jerseyvirus horsemountain, mit Salmonella-Phage horsemountain
      • Spezies Jerseyvirus jersey, mit Salmonella-Phage Jersey[8][A. 1]
      • Spezies Jerseyvirus shelanagig, mit Salmonella-Phage Shelanagig
      • Spezies Jerseyvirus sidste, mit Salmonella-Phage sitste
      • Spezies Jerseyvirus skrot, mit Salmonella-Phage skrot
      • Spezies …
      • Spezies „Salmonella phage MA12“ („Salmonella-Phage MA12“, alias „Salmonella enterica Serovar Enteritidis Bacteriophage MA12“); unterscheide: Pectobacterium-Phage MA12
    • Gattung Kagunavirus (früher K1gvirus, K1glikevirus; 15 Spezies)[A. 2]
      • Spezies Kagunavirus GAB2017, mit Escherichia-Phage G_AB-201
      • Spezies Kagunavirus golestan, mit Escherichia-Phage vB_EcoS-Golestan
      • Spezies Kagunavirus K1G, mit Escherichia-Phage K1G alias Escherichia-Phage K1-dep(4)
      • Spezies Kagunavirus K1H, mit Escherichia-Phage K1H
      • Spezies Kagunavirus K1ind1, mit Escherichia-Phage K1ind1
      • Spezies Kagunavirus K1ind2, mit Escherichia-Phage K1ind2
      • Spezies Kagunavirus LAB2017, mit Escherichia-Phage L_AB-2017
      • Spezies Kagunavirus RP180, mit Raoultella-Phage RP180
      • Spezies Kagunavirus ligaya, mit Escherichia-Phage vB_ (korrekt: Escherichia-Phage vB_VIPECOTH07)
      • Spezies Kagunavirus malou, mit Escherichia (korrekt: Escherichia-Phage vB_VIPECOTPH05A)
      • Spezies Kagunavirus ohbeberoi, mit Escherichia-Phage vB_VIPECOMC04
      • Spezies Kagunavirus PAB2017, mit Escherichia-Phage P_AB-2017
      • Spezies Kagunavirus RP180, mit Raoultella-Phage RP180
      • Spezies Kagunavirus ULINTec2, mit Escherichia-Phage ULINTec2
      • Spezies Kagunavirus UTI89UKE1, mit Escherichia-Phage vB_EcoS-UTI89UKE1
      • Spezies Kagunavirus UTICM001, mit Escherichia-Phage UTI-CM001
  • Unterfamilie nicht zugewiesen
    • Gattung Otakuvirus
      • Spezies Otakuvirus otaku, mit Serratia-Phage vB_SmaM-Otaku
      • Spezies Otakuvirus Tsm2, mit Serratia-Phage Tsm2
    • Gattung Seretavirus
      • Spezies Seretavirus eta, mit Serratia-Phage Eta

Etymologie

Die Bezeichnung der Familie Sarkviridae verweist auf Sark, die der Unterfamilie Guernseyvirinae auf Guernsey, und die der Gattung Jerseyvirus auf Jersey, drei der sieben bewohnten Kanalinseln im Ärmelkanal[2][3] – das Thema war begonnen worden mit der Benennung von Salmonella-Phage Jersey.[8] Die Suffixe ‚-viridae‘, ‚-virinae‘ und ‚-virus‘ bezeichnen Virusfamilien, -unterfamilien, bzw. -gattungen (inkl. -unter­gattungen).

Anmerkungen

  1. Salmonella-Phage Jersey ist nicht zu verwechseln mit:
  2. Namens-Korrekturen der Phagen nach NCBI Nucleotide.

Weiterführende Literatur

  • Ignacio Vasquez, Julio Retamales, Barbara Parra, Vimbai Machimbirike, James Robeson, Javier Santander: Comparative Genomics of a Polyvalent Escherichia-Salmonella Phage fp01 and In Silico Analysis of Its Receptor Binding Protein and Conserved Enterobacteriaceae Phage Receptor. In: MDPI: Viruses, And 15, Nr. 2, 28. Januar 2023, S. 379; doi:10.3390/v15020379, PMC 9961651 (freier Volltext), PMID 36851593 (englisch).

Einzelnachweise

  1. ICTV: MSL #40.v1, 3. März 2025.
  2. a b ICTV: Family: Sarkviridae.
  3. a b Liliana Cristina Moraru, Igor Tolstoy, Andrew M. Kropinki: Create a new family, Sarkviridae for the Jersey-like siphophages (Class: Caudoviricetes). Vorschlag 2024.031B (zip:docx). 4. Juni 2024, Stand: 30. September 2024.
  4. ICTV: MSL #41.v1, 20. März 2026.
  5. ICTV: Master Species Lists (MSL).
  6. Hany Anany, Andrea I. Moreno Switt, Niall De Lappe, Hans-Wolfgang Ackermann, Darren M. Reynolds, Andrew M. Kropinski, Martin Wiedmann, Mansel W. Griffiths, Denise Tremblay, Sylvain Moineau, John H. E. Nash, Dann Turner: A proposed new bacteriophage subfamily: “Jerseyvirinae”. In: Archives of Virology, Band 160, 8. Februar 2015, S. 1021–1033; doi:10.1007/s00705-015-2344-z, PMID 25663216 (englisch).
  7. SIB: Jerseyvirus. Auf: ViralZone.
  8. a b NCBI Taxonomy Browser: Salmonella phage Jersey; Nucleotide: Salmonella phage Jersey, complete genome, Accession: KF148055.
  9. PhagesDB: Mycobacterium phage Jersey

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