Nach dem Schulbesuch ab 1954 und Abitur 1965 an der Mittelschule Molėtai absolvierte Gylys von 1965 bis 1969 das Studium der Industrieplanung an der Vilniaus universitetas und lehrte von 1969 bis 1989 die Politische Ökonomie an der Wirtschaftsfakultät, von 1989 bis 1992 leitete er den Lehrstuhl für Produktionsmanagement und internationale Wirtschaftsbeziehungen, ab 2000 den Lehrstuhl für Theoretische Wirtschaft.
