Sugiura wuchs in Kota auf und studierte ab 1956 an der Universität Nagoya Biologie. Ab 1963 forschte er an der University of Illinois und 1965/66 an der University of California, San Diego (UCSD). Danach war er Assistent an den Universitäten Hiroshima und Kyoto und 1972 bis 1982 Laborleiter am Nationalen Institut für Genetik in Mishima. 1982 wurde er Professor an der Universität Nagoya, an der er 1986 bis zu seiner Emeritierung 2000 das Zentrum für Genforschung leitete. 2000 bis 2005 war er Dekan und Professor an der Städtischen Universität Nagoya, ab 2005 als Professor Emeritus. Ab 2010 war er University Professor an der Universität Nagoya.
Ihm gelang die erste Sequenzanalyse eines Chloroplasten-Genoms. Er sequenzierte diese bei mehreren höheren Pflanzen (insbesondere mit der Tabakpflanze als Modell). Die Arbeiten dauerten dazu zehn Jahre, begannen Ende der 1970er Jahre und gingen bis 1986 (Veröffentlichung der Nukleotidsequenz)[1] und ermöglichten neue Erkenntnisse über das Photosynthese-System auf Basis des Genoms, in dem dessen Bausteine kodiert sind. Die Arbeiten waren auch ein Vorgriff und eine Motivation für die Gensequenzierungsprojekte ab den 1990er Jahren, da sie zeigten, dass eine Gesamtsequenzierung effizienter als die Einzelsuche nach interessanten Genen war. Anschließend studierte er mit seiner Gruppe die molekularen Mechanismen der Gensequenzierung in Chloroplasten.
The chloroplast chromosomes in land plants. Annu. Rev. Cell Biol., 5, 1989, S. 51–70
mit anderen: Evolution and mechanism of translation in chloroplasts. Annu. Rev. Genetics, Band 32, 1998, S. 437–459
From plastid to cyanobacterial genomes, in: G. A. Peschek, W. Löffelhardt, G. Schmetterer, The Phototrophic Prokaryotes, Kluwer 1999, S. 411–420
History of chloroplast genomics, Photosynthesis Research (Historical Highlights of Photosynthesis Research, Part 2), Band 76, 2003, S. 371–377
RNA Editing in Chloroplasts, in: H. U. Goringer, RNA Editing, Springer Verlag 2008, S. 125–144
Translation in chloroplasts of flowering plants, in A.-M. Duchene u. a., Translation in Mitochondria and Other Organelles, Springer Verlag 2013, S. 207–224
Plastid mRNA translation, in: P. Maliga, Chloroplast Biotechnology: Methods and Protocols, Methods in Molecular Biology, Band 1132, Springer Verlag 2014, S. 73–91
↑Shinozaki, K., M. Ohme, M. Tanaka, T. Wakasugi, N. Hayashida, T. Matsubayashi, N. Zaita, J. Chunwongse, J. Obokata, K. Yamaguchi-Shinozaki, C. Ohto, K. Torazawa, B. Y. Meng, M. Sugita, H. Deno, T. Kamogashira, K. Yamada, J. Kusuda, F. Takaiwa, A. Kato, N. Tohdoh, H. Shimada, M. Sugiura: The complete nucleotide sequence of the tobacco chloroplast genome: its gene organization and expression. EMBO J., Band 5, 1986, S. 2043–2049. Die Sequenz wurde 1998 und 2005 aktualisiert
↑Masahiro Sugiura. Zentrum für Genforschung, Universität Nagoya, 3. Oktober 2014, abgerufen am 24. Oktober 2015 (japanisch).