Merckelbach stammt aus dem deutsch-niederländischen Adelsgeschlecht der Merckelbach. Sein Vater Thomas von Merckelbach war Assessor am Reichskammergericht in Speyer und seit 1608 mit Barbara Erhard verheiratet. Merckelbach wurde als erstes Kind dieses Ehepaares um 1609 geboren. 1660 heiratete er Freifrau Anna Maria von (der) Kula (1632–1670). Aus dieser Ehe gingen sieben Kinder hervor.
Johannes Helm: Johann Georg von Merckelbach. Oberamtmann der Herrschaft Badenweiler 1651–1680. In: Das Markgräflerland. Beiträge zu seiner Geschichte und seiner Kultur, Heft 1, 30 (1968), S. 21–28. Digitalisat der UB Freiburg
Fritz Strahler: Die Merckelbach in der Pfalz. In: Pfälzisch-Rheinische Familienkunde 9 (1978–81), S. 241–265
Siegmund Friedrich Gehres: Lebensbeschreibung von Dr. E. L. Posselt, nebst mehrern ungedruckten Briefen desselben und Biographischen Nachrichten von Durlach's denkwürdigen Männern.Kurze Lebensbeschreibung des vormaligen Baden-Durlachischen Hofraths, Hanns Georg von Merckelbach. Mannheim 1827, S. 117–121 Digitalisat