Hugo war der Sohn der preußischen Majorsa. D. Friedrich Karl Moritz von Obernitz (1786–1844) und dessen Ehefrau Wilhelmine, geborene Oesterreich (1879–1832).
Nach seiner Verabschiedung 1888 kaufte er mit seiner Ehefrau Anna, geborene von Usedom (1839–1913) die von 1849 bis 1851 von einem Herrn Vißer errichtete Villa in Bad Honnef, die heute unter dem Namen „Villa Modersohn“ auf dem Gelände der Rheinklinik steht. Auf dem Alten Friedhof von Bad Honnef ist heute noch der Grabstein von Hugo von Obernitz zu sehen, von dem 1988 der bronzene preußische Adler gestohlen wurde. Er hatte mit seiner Frau mehrere Kinder, darunter:
Friedrich Wilhelm Viktor Moritz Ferdinand (1860–1909), preußischer Regierungsrat ⚭ 26. Mai 1891 (Scheidung 5. März 1904) Maria von Niesewand (* 1870)[1]
Arthur Rudolf Eduard (* 1873) preußischer Major ⚭ 27. April 1898 Hedwig Günther (* 1876)
Statistisches Amt der Stadt Stuttgart (Hrsg.): Chronik der Kgl. Haupt- und Residenzstadt Stuttgart 1901. Greiner & Pfeiffer, Stuttgart 1901, S. 16ff2. (Digitalisat).