I 2003 kom han til Viborg Håndboldklub der netop var rykket ned i 1. division. Træner Ulrik Wilbek skiftede i sommeren 2003 klubbens damehold ud med herreholdet, og han skulle stå i spidsen for en hurtig tilbagevenden til den bedste række. Her hentede han blandt andet Andreas Toudahl, Per Leegaard og René Toft Hansen som nye spillere til Viborg HK.[3][4] I oktober 2004 forlængede Rene Toft og VHK kontrakten så den nu var gældende til sommeren 2008.[5]
4 år efter Rene Tofts ankomst til Viborg kom klubben i finalen om Danmarksmesterskabet 2006/07 mod GOG Svendborg, men tabte samlet og fik sølvmedaljer. Rene Toft Hansen havde forinden meddelt at KIF Kolding havde købt ham fri af kontrakten med Viborg HK et år før den udløb.[6]
KIF Kolding
Rene Toft Hansen tiltrådte i KIF Kolding efter sommerpausen i 2007. I 2009 vandt han sammen med klubben det danske mesterskab og fik sølvmedaljer i 2010. I sæsonerne 2007/08 og 2008/09 spillede Toft europæiske kampe i Cup Winners' Cup. I hans sidste sæson i klubben deltog han i EHF Champions League turneringen, men Kolding blev slået ud i 1/8 finalen af det franske storhold Montpellier HB med en samlet score på 49–54.[7]
AG København
Den 10. februar 2010 offentliggjorde AG København og Rene Toft Hansen, at de fra sommeren 2010 have indgået en 2-årig kontrakt. AG København var på det tidspunkt en fusionsklub der fra sæsonen 2010-11 overtog de fleste af F.C. København Håndbolds spillere efter dennes lukning.
[8]
Landshold
Rene Toft Hansen fik debut på ynglingelandsholdet 29. juni2001 og spillede frem til 2004 37 kampe og scorede 80 mål. Et halvt år efter skiftet til Viborg HK kom han på ungdomslandsholdet, da han 17. januar2004 debuterede og Rene Toft nåede i alt at blive noteret for 39 kampe og 99 mål for U-holdet.