Eitelberger spojoval ve své osobě vědce, kulturního politika a uměleckého kritika historismu. Je považován za zakladatele vídeňské školy dějin umění. Jím založené muzeum po vzoru Victoria and Albert Museum bylo první uměleckoprůmyslové muzeum na evropské pevnině a vzor pro další instituce ve střední Evropě.
Je pohřben na vídeňském centrálním hřbitově (sekce 14 A, číslo 31). V roce 1894 byla po něm ve Vídni pojmenována Eitelbergergasse.
Dne 18. dubna 2018 byla na rodném domě Rudolfa Eitelbergera v Olomouci (dnes Dům armády) odhalena pamětní deska (nahradila původní památník s německým nápisem, zničený v roce 1945), zřízená spolkem Za krásnou Olomouc.[1] Na vytvoření a umístění pamětní desky se podílelo též město Olomouc.[2]
Je po něm pojmenována Cena Rudolfa Eitelbergera udělovaná od roku 2008 za zdařilý počin v oblasti architektonické tvorby, urbanismu, památkové péče nebo práce s veřejností v Olomouci a Olomouckém kraji.[3]
↑Blanka Mazalová: Otce památkové péče bude v Olomouci ode dneška znovu připomínat pamětní deska (rozhlas.cz; 20180418). On-line.
↑Pavel Konečný: Na obnovu pamětní desky Rudolfa Eitelbergera věnovalo město sto tisíc korun, on-lineArchivováno 20. 4. 2018 na Wayback Machine. (olomouc.eu; 20180419).