Tomozin
Sintaksin-vezujući protein 5 jest protein koji je kod ljudi kodiran genom STXBP5 sa hromosoma 6 . Također je poznat kao tomozin , po japanskom 友 = "prijatelj" , zbog svoje uloge vezujućeg proteina.[ 5] [ 6] [ 7]
Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je 1.151 aminokiselina , a molekulska težina 127.573 Da .[ 7]
10 20 30 40 50 MRKFNIRKVL DGLTAGSSSA SQQQQQQHPP GNREPEIQET LQSEHFQLCK TVRHGFPYQP SALAFDPVQK ILAVGTQTGA LRLFGRPGVE CYCQHDSGAA VIQLQFLINE GALVSALADD TLHLWNLRQK RPAILHSLKF CRERVTFCHL PFQSKWLYVG TERGNIHIVN VESFTLSGYV IMWNKAIELS SKSHPGPVVH ISDNPMDEGK LLIGFESGTV VLWDLKSKKA DYRYTYDEAI HSVAWHHEGK QFICSHSDGT LTIWNVRSPA KPVQTITPHG KQLKDGKKPE PCKPILKVEF KTTRSGEPFI ILSGGLSYDT VGRRPCLTVM HGKSTAVLEM DYSIVDFLTL CETPYPNDFQ EPYAVVVLLE KDLVLIDLAQ NGYPIFENPY PLSIHESPVT CCEYFADCPV DLIPALYSVG ARQKRQGYSK KEWPINGGNW GLGAQSYPEI IITGHADGSV KFWDASAITL QVLYKLKTSK VFEKSRNKDD RPNTDIVDED PYAIQIISWC PESRMLCIAG VSAHVIIYRF SKQEVITEVI PMLEVRLLYE INDVETPEGE QPPPLPTPVG GSNPQPIPPQ SHPSTSSSSS DGLRDNVPCL KVKNSPLKQS PGYQTELVIQ LVWVGGEPPQ QITSLAVNSS YGLVVFGNCN GIAMVDYLQK AVLLNLGTIE LYGSNDPYRR EPRSPRKSRQ PSGAGLCDIS EGTVVPEDRC KSPTSGSSSP HNSDDEQKMN NFIEKVKTKS RKFSKMVAND IAKMSRKLSL PTDLKPDLDV KDNSFSRSRS SSVTSIDKES REAISALHFC ETFTRKTDSS PSPCLWVGTT LGTVLVIALN LPPGGEQRLL QPVIVSPSGT ILRLKGAILR MAFLDTTGCL IPPAYEPWRE HNVPEEKDEK EKLKKRRPVS VSPSSSQEIS ENQYAVICSE KQAKVISLPT QNCAYKQNIT ETSFVLRGDI VALSNSICLA CFCANGHIMT FSLPSLRPLL DVYYLPLTNM RIARTFCFTN NGQALYLVSP TEIQRLTYSQ ETCENLQEML GELFTPVETP EAPNRGFFKG LFGGGAQSLD REELFGESSS GKASRSLAQH IPGPGGIEGV KGAASGVVGE LARARLALDE RGQKLGDLEE RTAAMLSSAE SFSKHAHEIM LKYKDKKWYQ F
Struktura
Prvobitno su identificirane dva funkcionalna domena , uključujući jedan koji se veže za sintaksin , ali je nedavna kristalizacija homologa kvasca Sro7 otkrila da tomozin vjerovatno ima tri funkcionalna domena: jedan WD40 domen i jedan domen koji se veže za sintaksin, kao što je prethodno prepoznato, ali i drugi WD40 domen. Studija je također sugerirala da tomozinski 'sintaksin vezujući domen' nije razlog zašto tomozin inhibira oslobađanje neurotransmitera , kao što je prvobitno predloženo.[ 8] upredene zavojnice koji veže sintaksin vidljiv u infokutiji.[ 9]
Funkcija
Sintaksin 1 je komponenta 7S i 20S SNARE kompleksa koji su uključeni u preradu i fuziju sinapsnih vezikula sa presinapsnom plazmamembranom. Ovaj gen kodira protein koji se vezuje za sintaksin 1. Kod pacova, sličan protein disocira sintaksin 1 od kompleksa Munc18/n-Sec1/rbSec1, da bi se formirao 10S kompleks, intermedijer koji se može konvertovati u 7S SNARE kompleks. Stoga se smatra da je ovaj protein uključen u oslobađanje neurotransmitera, stimulirajući formiranje SNARE kompleksa. Identificirane su alternativno prerađene varijante transkripta , ali njihova biološka valjanost nije utvrđena.[ 7]
Poziciono kloniranje sugerira da tomozin može inhibirati lučenje neurotransmitera u neuronima Caenorhabditis elegans [ 10] vezikula – biohemijski korak koji neposredno prethodi fuziji vezikula i oslobađanju neurotransmitera.[ 11]
Interakcije
Pokazalo se da STXBP5 ima interakcije sa STX4 [ 12] STX1A .[ 5] [ 12]
Reference
^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000164506 - Ensembl , maj 2017^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000019790 - Ensembl , maj 2017^ "Human PubMed Reference:" . National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine .^ "Mouse PubMed Reference:" . National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine .^ a b Fujita Y, Shirataki H, Sakisaka T, Asakura T, Ohya T, Kotani H, Yokoyama S, Nishioka H, Matsuura Y, Mizoguchi A, Scheller RH, Takai Y (Jun 1998). "Tomosyn: a syntaxin-1-binding protein that forms a novel complex in the neurotransmitter release process" . Neuron . 20 (5): 905–15. doi :10.1016/S0896-6273(00)80472-9 PMID 9620695 . S2CID 12597505 . ^ Katoh M, Katoh M (Feb 2004). "Identification and characterization of human LLGL4 gene and mouse Llgl4 gene in silico". Int. J. Oncol . 24 (3): 737–42. doi :10.3892/ijo.24.3.737 . PMID 14767561 . ^ a b c "Entrez Gene: STXBP5 syntaxin binding protein 5 (tomosyn)" .^ Hattendorf DA, Andreeva A, Gangar A, Brennwald PJ, Weis WI (mart 2007). "Structure of the yeast polarity protein Sro7 reveals a SNARE regulatory mechanism". Nature . 446 (7135): 567–71. Bibcode :2007Natur.446..567H . doi :10.1038/nature05635 . PMID 17392788 . S2CID 4399611 . ^ "Q5T5C0" . SWISS-MODEL Repository .^ Dybbs M, Ngai J, Kaplan JM (juli 2005). "Using microarrays to facilitate positional cloning: identification of tomosyn as an inhibitor of neurosecretion" . PLOS Genet . 1 (1): 6–16. doi :10.1371/journal.pgen.0010002 . PMC 1183521 PMID 16103915 . ^ Gracheva EO, Burdina AO, Holgado AM, et al. (juli 2006). "Tomosyn inhibits synaptic vesicle priming in Caenorhabditis elegans" . PLOS Biol . 4 (8): e261. doi :10.1371/journal.pbio.0040261 . PMC 1514790 PMID 16895441 . ^ a b Widberg CH, Bryant NJ, Girotti M, Rea S, James DE (Sep 2003). "Tomosyn interacts with the t-SNAREs syntaxin4 and SNAP23 and plays a role in insulin-stimulated GLUT4 translocation" . J. Biol. Chem . 278 (37): 35093–101. doi :10.1074/jbc.M304261200 PMID 12832401 .
Dopunska literatura
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (2006). "Global, in vivo, and site-specific phosphorylation dynamics in signaling networks" . Cell . 127 (3): 635–48. doi :10.1016/j.cell.2006.09.026 PMID 17081983 . S2CID 7827573 . Widberg CH, Bryant NJ, Girotti M, Rea S, James DE (2003). "Tomosyn interacts with the t-SNAREs syntaxin4 and SNAP23 and plays a role in insulin-stimulated GLUT4 translocation" . J. Biol. Chem . 278 (37): 35093–101. doi :10.1074/jbc.M304261200 PMID 12832401 . Yokoyama S, Shirataki H, Sakisaka T, Takai Y (1999). "Three splicing variants of tomosyn and identification of their syntaxin-binding region". Biochem. Biophys. Res. Commun . 256 (1): 218–22. doi :10.1006/bbrc.1999.0300 . PMID 10066450 .
Vanjski linkovi
