Магнус II отива в шведския двор при крал Ерик XIV. Той се сгодява за сестрата на краля и през 1566 г. е главнокомандващ на шведската войска във войната против Дания. Скоро кралят го сменя. След короноването на крал Йохан III той се връща обратно в Германия.
През 1571 г. баща му се отказва от управлението в полза на по-малкия Франц II. Магнус II събира войска в Нидерландия и тръгва против Лауенбург. През началото на октомври 1574 г. той завладява и ограбва столицата Ратцебург. Когато долносаксонската войска наближава, той разпуска войската си и бяга в Швеция. Той започва да пие, тероризира съпругата си, сестра на краля. Той оставя съпругата и децата си и отново се връща в Германия.
През 1588 г. брат му го залавя Хамбург. Той живее още 15 години в затвор в една кула на двореца в Ратцебург. Погребан е в тамошната дворцова капела.
Фамилия
Магнус II се жени на 4 юли 1568 г. в Стокхолм за принцеса София Васа от Швеция (* 29 октомври 1547, † 17 март 1611), дъщеря на шведския крал Густав I Васа. Той има с нея две деца:
Otto von Heinemann: Magnus II. In: Allgemeine Deutsche Biographie (ADB). Band 20, Duncker & Humblot, Leipzig 1884, S. 72 f.
Wolf-Dieter Mohrmann: Magnus II. In: Neue Deutsche Biographie (NDB). Band 15, Duncker & Humblot, Berlin 1987, ISBN 3-428-00196-6, S. 668 f. (Digitalisat).