Той е син на граф Герлах II фон ЛимбургСтари († 1355) и втората му съпруга Кунигунда фон Вертхайм († 1362), дъщеря на граф Рудолф II фон Вертхайм († 1303/1306) и Мехтилд фон Дурн († ок. 1292).[1] Полубрат е на Йохан II фон Лимбург († 21 август 1336).
Йохан III е каноник в Кьолн и Трир и през 1365 г. наследява брат си Герлах III фон Лимбург като господар на Изенбург-Лимбург.
През май 1386 г. се жени за Хилдегард фон Сарверден († 25 октомври 1419), дъщеря на граф Йохан II фон Сарверден († сл. 1381) и Клара фон Финстинген-Бракенкопф († сл. 1365). Хилдегард е сестра на Фридрих III фон Сарверден († 1414), архиепископ на Кьолн (1370 – 1414). Тя наследява брат си граф Хайнрих III фон Сарверден († 18 юли 1397).
Йохан III е последният мъжки представител на род Лимбург. След смъртта му през 1406 г. Лимбург отива на архиепископа на Трир, на когото през 1344, 1346 и 1374 г., били заложени половината от града и замъка.
Кунигунда фон Изенбург-Лимбург († 15 март 1403), омъжена 1401 г. за граф Адолф фон Насау-Диленбург-Диц (* 1362; † 12 юни 1420)
Клара фон Изенбург-Лимбург (* 1388; † 29 септември 1401)
Литература
Tilemann Elhen von Wolfhagen, Peter Jentzmik: Eine wohlbeschriebene Chronick von der Stadt und den Herren zu Limpurg auff der Lahn. Glaukos Verlag, Limburg 2003, ISBN 3-930428-19-9.
G. Ulrich Großmann: Limburg an der Lahn, Führer durch die Stadt und ihre Geschichte. Trautvetter & Fischer, Marburg 2000, ISBN 3-87822-114-2.
Franz-Karl Nieder: Die Limburger Dynasten und die deutschen Könige 1292 bis 1356. Nassauische Annalen. 117, Verlag des Vereines für Nassauische Altertumskunde und Geschichtsforschung, Wiesbaden 2006, ISSN 0077 – 2887.
Europaische Stammtafeln, by Wilhelm Karl, Prinz zu Isenburg, Vol. I, Tafel 115., Vol. XVII, Tafel 71.
Detlev Schwennicke, Europaische Stammtafeln, New Series, Vol. XVII, Tafel 71.
