Сестра му Евфросина (1552 – 1590) се омъжва на 18 януари 1569 г. в Мюнхен за граф Карл II фон Хоенцолерн-Зигмаринген (1547 – 1606), братът на съпругата му Йохана.
Линията Йотинген-Шпилберг е образувана от Йотинген-Валерщайн през 1623/1694 г. и получава през 1731 г. след измирането на линията Йотинген-Йотинген една трета от техните собствености. През 1734 г. линията Йотинген-Шпилберг е издигната на князе. До днес линията на Шпилбергите притежават дворец Йотинген, замък Шпилберг (от 1363) и дворец Хиршбрун.
Деца
Вилхелм II фон Йотинген-Валерщайн-Шпилберг и графиня Йохана фон Хоенцолерн-Зигмаринген имат 21 деца:[2][3][4]
Албрехт (16 септември 1565 – 17 ноември 1565)
Якобея (*/+ 23 март 1567)
Анна (19 март 1568 – 13 февруари 1589)
Маргарета (* 1 юни 1569)
Вилхелм III (10 септември 1570 – 1600), граф на Йотинген-Шпилберг, женен на 2 октомври 1589 г. за Елизабет Фугер графиня цу Кирхберг и Вайсенхорн (10 юни 1570 – 12 март 1596)
Катарина (25 октомври 1571 – 1572)
Волфганг III (26 май 1573 – 7 септември 1598 във Виена), граф на Йотинген-Валерщайн, женен 1595 г. за Йохана де Мол (1 юни 1574 в Брюксел – 11 ноември 1614)
Мартин (7 март 1574 – 14 януари 1587)
Карл (28 август 1575 – 23 юли 1593 в Антверпен)
Фридрих (6 ноември 1576 – 9 август 1581/23 юли 1593)
Улрих (13 февруари 1578 – 30 септември 1605 в Комаром, Унгария), граф на Йотинген-Валерщайн, женен на 25 януари 1604 г. в Аугсбург за Барбара Фугер фрайин цу Кирхберг и Вайсенхорн (7 ноември 1577 – 4 май 1618)
Мария Салома (5 април 1579 – 10 юни 1579)
Сидония (21 август 1580 – 12 март 1582)
Мария (10 януари 1582 – 13 март 1647), омъжена на 1 февруари 1616 г. за граф Карл Лудвиг фон Зулц (9 август 1560 – 29 септември 1616)
Анна Якобея (8 септември 1583 – 22 септември 1583)
Ернст I (24 октомври 1584 – 18 май 1626), граф на Йотинген-Балдерн, женен на 20 септември 1608 г. във Визенщайг за графиня Катарина фон Хелфенщайн-Визенщайг (9 декември 1589 – 12 януари 1638 в Бохемия)