حلّقت أول طائرة في سماء باكو بتاريخ 20 تشرين الأول/ أكتوبر 1910. هذه الخطوة فتحت مجالاً جديداً للطيران في أذربيجان إذ لم يستغرق الأمر سوى 13 عاماً حتى اكتسب النمط الجديد في النقل طابعاً رسمياً على المستوى الإقليمي. حيث شهد العام 1923 إطلاق شركة -زاقافيا- الشركة القوقازية المساهمة للطيران المدني. أما الشركات التي ساهمت في تأسيس الشركة القوقازية فهي: شركة إنشاءات موغان لتحسين الأراضي وشركة شحن قزوين وشركة نفط أذربيجان(آزنيفت). كانت تقتصر مهمة طائرات زاكافيا في تلك المرحلة على إجراء مسح جوي للمناطق بالإضافة إلى نقل المساعدات في الحلات الطارئة، وإيصال البريد جواً.
في تاريخ 22 تموز/ يوليو 2010 وقعت شركة بوينغ والخطوط الجوية الأذربيجانية اتفاقاً يقضي بإستبدال طائرتين من طراز الجيل القادم 737، بطائرة واحدة من طراز بوينغ 767-300 أي آر (بعيدة المدى) وطائرتي شحن من طراز بوينغ 767.وبذلك تكون الخطوط الجوية الأذربيجانية قد طلبت من شركة بوينغ ما مجموعه ثماني طائرات: طائرتين من طراز767-300 أي آر، وطائرتي شحن من طراز 767، وطائرتين من طراز الجيل القادم 737، وطائرتين من طراز 787-8.[1]
وفي أيلول/ سبتمبر 2010، ألغت آزال طلبية شراء الطائرتين المتبقيتين من طراز الجي القادم 737.
وفي 24 كانون الأول/ ديسمبر عام 2010، توقفت الخطوط الجوية الأذربيجانية عن استخدام طائرات التوبوليف روسية الصنع.
في كانون الثاني/ يناير 2011، تم إجماع على منح الخطوط الجوية الأذربيجانية التصنيف الأوروبي للخدمة من الغرفة الإقتصادية الأوروبية للتجارة والصناعة والتبادل التجاري.[2]
في تاريخ 2 حزيران/ يونيو 2011، تسلّمت الخطوط الجوية الأذربيجانية أول طائرتين من طراز بوينغ 767-300 أي آر حيث يُتوقع أن يتم استخدامها لخدمة منطقة جنوب شرق آسيا. ومن المتوقع أن يتم تسليم طائرة البوينغ 763 وطائرتي البوينغ من طراز 767-300اف في عام 2012.
وفي تاريخ 23 و24 كانون الأول/ ديسمبر 2014 تسلّمت الخطوط الجوية الأذربيجانية طائرتي البوينغ طراز 787 دريملاينرز والتي كانت الشركة قد طلبتهما سابقاً.ومع انضمام الطائرة من طراز 787 إلى أسطولها أطلقت خطوط الطيران هذه الدرجة السياحية الممتازة.[3]
سبق للخطوط الجوية الأذربيجانية تشغيل عدد من الطائرات، وكانت أكثر طائراتها شيوعًا هي توبوليف تو 154 حتى سحبها في عام 2013. جميع الطائرات التي استخدمتها الخطوط الجوية الأذربيجانية مذكورة أدناه.