Karena Kali Kuning berhulu langsung di kawah Gunung Merapi, secara otomatis akan menjadi lintasan lahar ketika Gunung Merapi bererupsi, sehingga berdampak langsung terhadap segala sesuatu berada di pinggir sungai, termasuk Candi Kadisoka dan Candi Sambisari yang terkubur beberapa meter oleh material lahar dingin.[2]
Di bawah hulu Kali Kuning yang berada di lereng Merapi terdapat area outbond dan bumi perkemahan karena lingkungan yang sejuk dan nyaman serta masih alami.[1][3][4] Di bagian hulu, tepatnya di jalan penghubung
