2006年亚洲运动会即第十六届亚运会，又称多哈亚运会，是于2006年12月1日至15日在卡塔尔首都多哈举办的综合运动会。本奖牌榜以各参与成员国之运动员所获得的奖牌数排行。本表格的排行计算方式与国际奥林匹克委员会所公告的奖牌榜相符。依照惯例，表格以参赛国运动员所获得的总金牌数做为排行的首要依据，其次依序为为银牌数及铜牌数。如果比序至此各参赛国仍然持平，则判定为同名次，并依据国际奥委会国家编码的字母顺序排列。

排名	国家／地区	金牌	银牌	铜牌	總數
1	中国（CHN）[1]	165	88	63	316
2	韩国（KOR）	58	52	82	192
3	日本（JPN）	50	71	78	199
4	哈萨克斯坦（KAZ）	23	20	42	85
5	泰国（THA）	13	15	26	54
6	伊朗（IRI）	11	15	22	48
7	乌兹别克斯坦（UZB）	11	14	15	40
8	印度（IND）	10	17	26	53
9	卡塔尔（QAT）[2]	9	12	11	32
10	中华台北（TPE）	9	10	27	46
11	马来西亚（MAS）	8	17	17	42
12	新加坡（SIN）	8	7	12	27
13	沙特阿拉伯（KSA）	8	0	6	14
14	巴林（BRN）	7	9	4	20
15	中国香港（HKG）	6	12	11	29
16	朝鲜（PRK）	6	9	16	31
17	科威特（KUW）	6	5	2	13
18	菲律宾（PHI）	4	6	9	19
19	越南（VIE）	3	13	7	23
20	阿拉伯联合酋长国（UAE）	3	4	3	10
21	蒙古（MGL）	2	5	8	15
22	印度尼西亚（INA）	2	4	14	20
23	叙利亚（SYR）	2	2	2	6
24	塔吉克斯坦（TJK）	2	0	2	4
25	约旦（JOR）	1	3	4	8
26	黎巴嫩（LIB）	1	0	2	3
27	缅甸（MYA）	0	4	7	11
28	吉尔吉斯斯坦（KGZ）	0	2	6	8
29	伊拉克（IRQ）	0	2	1	3
30	中国澳门（MAC）	0	1	6	7
31	巴基斯坦（PAK）	0	1	3	4
32	斯里兰卡（SRI）	0	1	2	3
33	老挝（LAO）	0	1	0	1
33	土库曼斯坦（TKM）	0	1	0	1
35	尼泊尔（NEP）	0	0	3	3
36	阿富汗（AFG）	0	0	1	1
36	孟加拉国（BAN）	0	0	1	1
36	也门（YEM）	0	0	1	1
Total		428	423	542	1393

裁决日期	运动项目	赛事	国家／地区	金牌	银牌	铜牌	总计
2006年12月11日	举重	女子75公斤级	缅甸		–1		–1
			韩国		+1	–1	0
			印度尼西亚			+1	+1
2006年12月18日	田径	女子800米	印度		–1		–1
			哈萨克斯坦		+1	–1	0
			乌兹别克斯坦			+1	+1
2007年5月15日	健美	男子70公斤级	巴林		–1		–1
			印度尼西亚		+1	–1	0
			日本			+1	+1
2007年5月15日	健美	男子90级	韩国		–1		–1
			叙利亚		+1	–1	0
			中国香港			+1	+1

2006年12月11日，亚奥理事会宣布，缅甸女子举重运动员妙·珊达被查出使用兴奋剂，她的银牌成绩因此被取消。原来位于第三名和第四名的韩国和印尼运动员分别递补为银牌和铜牌。^[3]

印度选手女子800米银牌得主因为赛后性别测试没有过关，因此被剥夺银牌。^[4]

• 第15届 2006年多哈亚运会