Після відвідин Аризонського метеоритного кратера (1952 року) зацікавився походженням кратерів на Місяці. Виконав порівняльне дослідження невеликого кратера, що утворився внаслідок ядерного вибуху в Юті, з Аризонським кратером. 1954 року отримав диплом фахівця. Докторський ступінь отримав 1960 року за дослідження Аризонського кратера.
З 1961 року навчав геології астронавтів місячної програми. Мріяв сам побувати на Місяці, але 1963 року в нього виявили Аддісонову хворобу, що перешкодило йому стати астронавтом.
Після заснування у Флегстаффі центру астрогеології (1965) призначений туди головним дослідником. Був координатором селенологічних досліджень під час висадки на Місяці[6].
Юджин Шумейкер став першою людиною, чиї рештки було поховано на Місяці. В 1998 році прах Шумейкера відправили на борту апарата Lunar Prospector. Кратер на південному полюсі супутника, куди впав апарат, отримав назву «кратер Шумейкера»[10].
Юджину Шумейкеру присвячена пісня Shoemaker з альбому Human. :||: Nature. гурту Nightwish.
↑ абBrian Marsden (18 липня 1997). Eugene Shoemaker (1928-1997). Jet Propulsion Laboratory. Архів оригіналу за 1 лютого 2010. Процитовано 30.03.2016. (англ.)
↑Gerard P. Kuiper Prize in Planetary Sciences. Gerard P. Kuiper Prize in Planetary Sciences. Division for Planetary Sciences of the American Astronomical Society. Архів оригіналу за 12 вересня 2012. Процитовано 30.03.2016.