Вихованець клубу «Універсідад Католіка». У віці 18 років він був включений в заявку основної команди. 22 червня2009 року в матчі проти «Сантьяго Морнінг» Феліпе дебютував у чилійській Прімері[1]. У своєму першому сезоні він лише двічі зіграв у чемпіонаті, але вже з наступного сезону завоював місце в основі. 31 липня2010 року в поєдинку проти «О'Хіггінс» Гутьєррес забив свій перший гол за «Універсідад»[2]. У цьому ж сезоні він допоміг клубу виграти національну першість, а через рік і Кубок Чилі.