Вихованець «Сталі» (Алчевськ), до структури якої потрапив у 17 років після завершення школи. У змаганнях під егідою ДЮФЛУ провів за алчевську «Сталь» 78 матчів, забив 14 м'ячів. Перший тренер — Шаповалов О. Г. Виступав за молодіжну команду «Сталі», в основі провів лише одну гру в Кубку України.
Тренери молодіжки харківського «Металіста» помітили високого захисника в одному з матчів своєї команди проти «Сталі». Згодом йому було запропоновано виступати у складі «Металіста» і Селін погодився. До «Металіста» перейшов у березні 2007 року. У Харкові, однак, отримувати гідну ігрову практику Селіну не вдалося. За два перші сезони за основу «Металіста» в Прем'єр-лізі він зіграв лише два матчі (дебют 8 березня 2009 року проти ФК «Львів» — 1:1, вийшов на заміну на 80 хвилині замість Віталія Бордіяна), виступаючи переважно за молодіжний склад харків'ян.
Перед початком сезону 2009—2010 перейшов на умовах піврічної оренди до полтавської «Ворскли»[1], після завершення якої полтавський клуб повністю викупив гравця[2]. Всього провів в складі полтавської команди в Прем'єр-лізі 74 матчі і забив шість голів.
3 січня 2013 року підписав п'ятирічний контракт з київським «Динамо»[3], яке заплатило за футболіста 2 млн євро[4].
20 грудня 2016 року як вільний агент офіційно став гравцем грецького клубу «Астерас», підписавши контракт до червня 2018 року[5].
У складі української «молодіжки» був учасником фінального етапу молодіжного чемпіонату Європи 2011 року, в рамках якого взяв участь у двох з трьох ігор команди на турнірі.
За національну збірну України дебютував у матчі з Болгарією 7 жовтня 2011 року, в тому ж матчі забив дебютний гол[6]. З того часу Євген став основним лівим захисником національної збірної та влітку 2012 року був включений до складу команди для участі на домашньому Євро, на якому зіграв в усіх трьох матчах.
Матчі Євгена Селіна за національну збірну України станом на 17 листопада2014 року
До футбольної школи пішов одночасно із звичайною, в шість років, займаючись паралельно легкою атлетикою.
Пропускаючи матч чемпіонату з «Кривбасом», він, ще граючи за «Ворсклу», приєднався на своїй машині до фанатського кортежу, який традиційно супроводжує полтавських футболістів на чергову домашню гру.