Прапор Сан-Томе і Принсіпі — один з офіційних символів держави Сан-Томе і Принсіпі. Був прийнятий 5 листопада 1975 р.
Червоний трикутник символізує запеклу боротьбу за незалежність, дві чорні зірки означають два найбільші острови держави (Сан-Томе і Принсіпі). Зелений, жовтий і чорний кольори є панафриканськими.