У травні 1872 року міністр народної освіти графД. А. Толстой дав згоду на відкриття в Москві вищих жіночих курсів як приватного навчального закладу і затвердив «Положення про курси».
Спочатку навчання було розраховано на 2 роки, а з 1886 року — 3 роки. У 1900 році термін навчання збільшився до чотирьох років. У програму навчання входили як гуманітарні науки, так і природні.
Забезпечення московських курсів було вкрай обмежено; субсидію у розмірі 500 руб. на рік, вони отримували лише від купецької управи, і то лише з 1878 р. Головними чином кошти курсів складалися з добровільних пожертвувань і плати з слухачок. Заняття були платними, 50 карбованців на рік.
У жовтні 1869 відкрилися в Москві, в будівлі 2-ї гімназії, а потім на Луб'янці «публічні курси для жінок за програмою чоловічих класичних гімназій» (луб'янські курси). Всі ці курси управлялися виборними з середовища слухачок. Відкриття в Москві курсів В. І. Герье не могло не відбитися на Луб'янській курсах, але призвело не до закриття їх, а до спеціалізації: вони поступово засвоїли собі університетський характер, а з 1882 р. остаточно перетворилися на фізико-математичний факультет, з чотирирічним курсом викладання і з двома відділеннями, математичним та природним.
На знову відкритих курсах було два відділення — історико-філологічне і фізико-математичне. У 1906 році був відкритий медичний факультет (нині РГМУ).
Раді курсів давалося право відкривати нові факультети і відділення, вводити нові дисципліни і змінювати навчальні програми.
3 червня 1907 відбулася закладка будівель навчальних корпусів (архітектор C. У. Соловйов) на земельній ділянці по Малої Царицинської (нині Мала Пироговська) вулиці. Зараз ця будівля займає головний корпус МПДУ. Будівля аудиторного корпусу зображено на нинішній емблемі МПДУ.
У 1915—1916 навчальному році Московським вищим жіночим курсам було надано право проведення випускних іспитів та видачі дипломів про вищу освіту. До 1918 року курси нараховували 8,3 тисячі учнів і за чисельністю поступалися тільки МДУ.