У дорослому футболі дебютував 2005 року виступами за команду «Універсідад», в якій провів один сезон. Після цього виступав на батьківщині за клуби «Олімпія» та «Депортіво Вікторія». У складі столичної команди Карлос двічі виграв чемпіонат Гондурасу.
У 2010 році він перейшов в «Коммунікасьйонес». З новим клубом Діскуа виграв чемпіонат Гватемали, після чого повернувся на батьківщину в «Мотагуа». 3 листопада в поєдинку проти «Види» він забив свій перший гол за команду[2]. 11 серпня 2014 року в матчі проти «Гондурас Прогресо» Карлос зробив хет-трик[3]. У 2015 році він став чемпіоном Гондурасу в складі «Мотагуа».
У червні 2016 року Діскуа повернувся в Гондурас, підписавши річний контракт зі своїм колишнім клубом «Мотагуа»[5]. Відтоді встиг відіграти за костариканську команду 33 матчі в національному чемпіонаті.