Територія архіпелагу і навколишні водні ресурси охороняються як державою (національний парк Оранг і морський національний парк), так і міжнародними програмами. З 1996 року архіпелаг входить у всесвітню мережу біосферних резерватів ЮНЕСКО[2][3][4].
Острови Біжаґош здавна були одним з центрів прибережної торгівлі Західної Африки, і тому володіли великим флотом, що допомогло їм відбити португальський напад у 1535 році. Лише в 1936 році острови були повністю підкорені португальцями і включені до складу колонії «Португальська Гвінея». В даний час вони входять до складу республіки Гвінея-Бісау.
2009 року на архіпелазі проживало 34 563 особи, що розмовляють мовою біджа. Близько двох десятків островів є безлюдними.