RNF111
Ідентифікатори
Символи RNF111 Зовнішні ІД
OMIM : 605840 MGI: 1934919 HomoloGene: 9741 GeneCards: RNF111
Онтологія гена Молекулярна функція
• SUMO polymer binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • transferase activity • SMAD binding
Клітинна компонента
• нуклеоплазма • клітинне ядро • цитоплазма • гіалоплазма • PML body • GO:0009327 protein-containing complex
Біологічний процес
• GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • ubiquitin-dependent SMAD protein catabolic process • protein polyubiquitination • multicellular organism development • positive regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway • positive regulation of protein ubiquitination • pattern specification process • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • Убіквітин-залежний протеоліз • global genome nucleotide-excision repair • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0100026 Репарація ДНК • cellular response to DNA damage stimulus • ubiquitin-dependent protein catabolic process
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних Ортологи
Види
Людина Миша Entrez Ensembl UniProt RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 15: 58.87 – 59.1 Mb Хр. 9: 70.33 – 70.41 Mb PubMed search[ 1] [ 2] Вікідані
RNF111 (англ. Ring finger protein 111 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.[ 3] амінокислот , а молекулярна маса — 108 862[ 4]
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50 MSQWTPEYNE LYTLKVDMKS EIPSDAPKTQ ESLKGILLHP EPIGAAKSFP AGVEMINSKV GNEFSHLCDD SQKQEKEMNG NQQEQEKSLV VRKKRKSQQA GPSYVQNCVK ENQGILGLRQ HLGTPSDEDN DSSFSDCLSS PSSSLHFGDS DTVTSDEDKE VSVRHSQTIL NAKSRSHSAR SHKWPRTETE SVSGLLMKRP CLHGSSLRRL PCRKRFVKNN SSQRTQKQKE RILMQRKKRE VLARRKYALL PSSSSSSEND LSSESSSSSS TEGEEDLFVS ASENHQNNPA VPSGSIDEDV VVIEASSTPQ VTANEEINVT STDSEVEIVT VGESYRSRST LGHSRSHWSQ GSSSHASRPQ EPRNRSRIST VIQPLRQNAA EVVDLTVDED EPTVVPTTSA RMESQATSAS INNSNPSTSE QASDTASAVT SSQPSTVSET SATLTSNSTT GTSIGDDSRR TTSSAVTETG PPAMPRLPSC CPQHSPCGGS SQNHHALGHP HTSCFQQHGH HFQHHHHHHH TPHPAVPVSP SFSDPACPVE RPPQVQAPCG ANSSSGTSYH EQQALPVDLS NSGIRSHGSG SFHGASAFDP CCPVSSSRAA IFGHQAAAAA PSQPLSSIDG YGSSMVAQPQ PQPPPQPSLS SCRHYMPPPY ASLTRPLHHQ ASACPHSHGN PPPQTQPPPQ VDYVIPHPVH AFHSQISSHA TSHPVAPPPP THLASTAAPI PQHLPPTHQP ISHHIPATAP PAQRLHPHEV MQRMEVQRRR MMQHPTRAHE RPPPHPHRMH PNYGHGHHIH VPQTMSSHPR QAPERSAWEL GIEAGVTAAT YTPGALHPHL AHYHAPPRLH HLQLGALPLM VPDMAGYPHI RYISSGLDGT SFRGPFRGNF EELIHLEERL GNVNRGASQG TIERCTYPHK YKKVTTDWFS QRKLHCKQDG EEGTEEDTEE KCTICLSILE EGEDVRRLPC MHLFHQVCVD QWLITNKKCP ICRVDIEAQL PSES
Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз , білків розвитку .
Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК , убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку .
Локалізований у цитоплазмі , ядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504 Sun H., Hunter T. (2012). PolySUMO-binding proteins identified through a string search. J. Biol. Chem . 287 : 42071—42083. PMID 23086935 DOI :10.1074/jbc.M112.410985 Wright J.D., Mace P.D., Day C.L. (2016). Secondary ubiquitin-RING docking enhances Arkadia and Ark2C E3 ligase activity. Nat. Struct. Mol. Biol . 23 : 45—52. PMID 26656854 DOI :10.1038/nsmb.3142 Chasapis C.T., Kandias N.G., Episkopou V., Bentrop D., Spyroulias G.A. (2012). NMR-based insights into the conformational and interaction properties of Arkadia RING-H2 E3 Ub ligase. Proteins . 80 : 1484—1489. PMID 22411132 DOI :10.1002/prot.24048
