PROFILPELAJAR.COM

LMO2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2XJY, 2XJZ, 2YPA, 4KFZ
Ідентифікатори
Символи	LMO2, RBTN2, RBTNL1, RHOM2, TTG2, LIM domain only 2, LMO-2
Зовнішні ІД	OMIM: 180385 MGI: 102811 HomoloGene: 4072 GeneCards: LMO2
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • bHLH transcription factor binding; • E-box binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • зв'язування з іоном металу;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • transcription regulator complex; • нуклеоплазма;
Біологічний процес	• multicellular organism development; • mRNA transcription by RNA polymerase II; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • cellular response to thyroid hormone stimulus; • regulation of hematopoietic stem cell differentiation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	4005
	16909
	ENSG00000135363
	ENSMUSG00000032698
	P25791
	P25801
	NM_001142315; NM_001142316; NM_005574
	NM_001142335; NM_001142336; NM_001142337; NM_008505
	NP_001135787; NP_001135788; NP_005565
	NP_001135807; NP_001135808; NP_001135809; NP_032531
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

LMO2 (англ. LIM domain only 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 158 амінокислот, а молекулярна маса — 18 358^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSSAIERKSL	DPSEEPVDEV	LQIPPSLLTC	GGCQQNIGDR	YFLKAIDQYW
HEDCLSCDLC	GCRLGEVGRR	LYYKLGRKLC	RRDYLRLFGQ	DGLCASCDKR
IRAYEMTMRV	KDKVYHLECF	KCAACQKHFC	VGDRYLLINS	DIVCEQDIYE
WTKINGMI

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Mao S., Neale G.A.M., Goorha R.M. (1997). T-cell oncogene rhombotin-2 interacts with retinoblastoma-binding protein 2. Oncogene. 14: 1531—1539. PMID 9129143 DOI:10.1038/sj.onc.1200988
Royer-Pokora B., Loos L., Ludwig W.D. (1991). TTG-2, a new gene encoding a cysteine-rich protein with the LIM motif, is overexpressed in acute T-cell leukaemia with the t(11;14)(p13;q11). Oncogene. 6: 1887—1893. PMID 1923511

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6642 (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2016. Процитовано 8 вересня 2017. [Архівовано 2016-09-26 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, P25791 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 11

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6642 (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2016. Процитовано 8 вересня 2017. [Архівовано 2016-09-26 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, P25791 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]