PROFILPELAJAR.COM

HIST1H1E
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3TZD, 5JJZ
Ідентифікатори
Символи	H1-4, histone cluster 1, H1e, H1.4, H1E, H1F4, H1s-4, dJ221C16.5, histone cluster 1 H1 family member e, RMNS, HIST1H1E, H1.4 linker histone, cluster member
Зовнішні ІД	OMIM: 142220 MGI: 1931527 HomoloGene: 130534 GeneCards: H1-4
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • chromatin DNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • RNA binding; • nucleotide binding; • double-stranded DNA binding; • calcium ion binding; • ATP binding; • GTP binding; • AMP binding; • dATP binding; • ADP binding; • nucleosomal DNA binding;
Клітинна компонента	• Нуклеосома; • екзосома; • клітинне ядро; • хромосома;
Біологічний процес	• GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II; • histone H3-K4 trimethylation; • nucleosome assembly; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • histone H3-K27 trimethylation; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • chromosome condensation; • negative regulation of DNA recombination;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	3008
	50709
	ENSG00000168298
	ENSMUSG00000051627
	P10412
	P43274
	NM_005321
	NM_015787
	NP_005312; NP_005312.1
	NP_056602
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

HIST1H1E (англ. Histone cluster 1 H1 family member e) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 219 амінокислот, а молекулярна маса — 21 865^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSETAPAAPA	APAPAEKTPV	KKKARKSAGA	AKRKASGPPV	SELITKAVAA
SKERSGVSLA	ALKKALAAAG	YDVEKNNSRI	KLGLKSLVSK	GTLVQTKGTG
ASGSFKLNKK	AASGEAKPKA	KKAGAAKAKK	PAGAAKKPKK	ATGAATPKKS
AKKTPKKAKK	PAAAAGAKKA	KSPKKAKAAK	PKKAPKSPAK	AKAVKPKAAK
PKTAKPKAAK	PKKAAAKKK

A: Аланін

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Y: Тирозин

Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

Albig W., Kardalinou E., Drabent B., Zimmer A., Doenecke D. (1991). Isolation and characterization of two human H1 histone genes within clusters of core histone genes. Genomics. 10: 940—948. PMID 1916825 DOI:10.1016/0888-7543(91)90183-F
Marzluff W.F., Gongidi P., Woods K.R., Jin J., Maltais L.J. (2002). The human and mouse replication-dependent histone genes. Genomics. 80: 487—498. PMID 12408966 DOI:10.1006/geno.2002.6850
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Parseghian M.H., Newcomb R.L., Winokur S.T., Hamkalo B.A. (2000). The distribution of somatic H1 subtypes is non-random on active vs. inactive chromatin: distribution in human fetal fibroblasts. Chromosome Res. 8: 405—424. PMID 10997781 DOI:10.1023/A:1009262819961
Th'ng J.P., Sung R., Ye M., Hendzel M.J. (2005). H1 family histones in the nucleus. Control of binding and localization by the C-terminal domain. J. Biol. Chem. 280: 27809—27814. PMID 15911621 DOI:10.1074/jbc.M501627200
Ohe Y., Hayashi H., Iwai K. (1986). Human spleen histone H1. Isolation and amino acid sequence of a main variant, H1b. J. Biochem. 100: 359—368. PMID 3782055

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4718 (англ.) . Архів оригіналу за 2 липня 2017. Процитовано 28 лютого 2017. [Архівовано 2017-07-02 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, P10412 (англ.) . Архів оригіналу за 1 лютого 2017. Процитовано 28 лютого 2017.

Див. також

Хромосома 6

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4718 (англ.) . Архів оригіналу за 2 липня 2017. Процитовано 28 лютого 2017. [Архівовано 2017-07-02 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, P10412 (англ.) . Архів оригіналу за 1 лютого 2017. Процитовано 28 лютого 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]