PROFILPELAJAR.COM

AGO1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1SI2, 1SI3, 4KRE, 4KRF, 4KXT
Ідентифікатори
Символи	AGO1, EIF2C, EIF2C1, GERP95, Q99, hAgo1, argonaute 1, RISC catalytic component, argonaute RISC catalytic component 1, argonaute RISC component 1
Зовнішні ІД	OMIM: 606228 MGI: 2446630 HomoloGene: 81826 GeneCards: AGO1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• RNA polymerase II complex binding; • miRNA binding; • endoribonuclease activity; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • single-stranded RNA binding; • RNA binding; • nucleic acid binding; • double-stranded RNA binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • Полісома; • гіалоплазма; • RISC; • P-body; • нуклеоплазма; • RISC-loading complex; • клітинне ядро; • Рибонуклеопротеїни;
Біологічний процес	• mRNA destabilization-mediated gene silencing by siRNA; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • transcription, DNA-templated; • pre-miRNA processing; • nuclear-transcribed mRNA catabolic process; • GO:1901313 positive regulation of gene expression; • GO:0035194 РНК-інтерференція; • miRNA-mediated gene silencing by inhibition of translation; • RNA secondary structure unwinding; • mRNA destabilization-mediated gene silencing by miRNA; • GO:0061715 miRNA metabolic process; • regulation of translation; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • production of miRNAs involved in gene silencing by miRNA; • positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling; • Wnt signaling pathway, calcium modulating pathway; • Сайленсинг генів; • GO:1905616 regulation of gene silencing by miRNA; • regulation of megakaryocyte differentiation; • negative regulation of gene expression; • negative regulation of angiogenesis; • RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	26523
	236511
	ENSG00000092847
	ENSMUSG00000041530
	Q9UL18
	Q8CJG1
	NM_012199; NM_001317122; NM_001317123
	NM_153403; NM_001317173; NM_001317174; NM_001378879
	NP_001304051; NP_001304052; NP_036331
	NP_001304102; NP_001304103; NP_700452; NP_001365808
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

AGO1 (англ. Argonaute 1, RISC catalytic component) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 857 амінокислот, а молекулярна маса — 97 214^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEAGPSGAAA	GAYLPPLQQV	FQAPRRPGIG	TVGKPIKLLA	NYFEVDIPKI
DVYHYEVDIK	PDKCPRRVNR	EVVEYMVQHF	KPQIFGDRKP	VYDGKKNIYT
VTALPIGNER	VDFEVTIPGE	GKDRIFKVSI	KWLAIVSWRM	LHEALVSGQI
PVPLESVQAL	DVAMRHLASM	RYTPVGRSFF	SPPEGYYHPL	GGGREVWFGF
HQSVRPAMWK	MMLNIDVSAT	AFYKAQPVIE	FMCEVLDIRN	IDEQPKPLTD
SQRVRFTKEI	KGLKVEVTHC	GQMKRKYRVC	NVTRRPASHQ	TFPLQLESGQ
TVECTVAQYF	KQKYNLQLKY	PHLPCLQVGQ	EQKHTYLPLE	VCNIVAGQRC
IKKLTDNQTS	TMIKATARSA	PDRQEEISRL	MKNASYNLDP	YIQEFGIKVK
DDMTEVTGRV	LPAPILQYGG	RNRAIATPNQ	GVWDMRGKQF	YNGIEIKVWA
IACFAPQKQC	REEVLKNFTD	QLRKISKDAG	MPIQGQPCFC	KYAQGADSVE
PMFRHLKNTY	SGLQLIIVIL	PGKTPVYAEV	KRVGDTLLGM	ATQCVQVKNV
VKTSPQTLSN	LCLKINVKLG	GINNILVPHQ	RSAVFQQPVI	FLGADVTHPP
AGDGKKPSIT	AVVGSMDAHP	SRYCATVRVQ	RPRQEIIEDL	SYMVRELLIQ
FYKSTRFKPT	RIIFYRDGVP	EGQLPQILHY	ELLAIRDACI	KLEKDYQPGI
TYIVVQKRHH	TRLFCADKNE	RIGKSGNIPA	GTTVDTNITH	PFEFDFYLCS
HAGIQGTSRP	SHYYVLWDDN	RFTADELQIL	TYQLCHTYVR	CTRSVSIPAP
AYYARLVAFR	ARYHLVDKEH	DSGEGSHISG	QSNGRDPQAL	AKAVQVHQDT
LRTMYFA

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, рибонуклеопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як регуляція трансляції, транскрипція, регуляція транскрипції, РНК-залежне заглушення генів. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Chu C.-Y., Rana T.M. (2006). Translation repression in human cells by microRNA-induced gene silencing requires RCK/p54. PLoS Biol. 4: E210—E210. PMID 16756390 DOI:10.1371/journal.pbio.0040210
Wu L., Fan J., Belasco J.G. (2008). Importance of translation and nonnucleolytic ago proteins for on-target RNA interference. Curr. Biol. 18: 1327—1332. PMID 18771919 DOI:10.1016/j.cub.2008.07.072
Phalora P.K., Sherer N.M., Wolinsky S.M., Swanson C.M., Malim M.H. (2012). HIV-1 replication and APOBEC3 antiviral activity are not regulated by P bodies. J. Virol. 86: 11712—11724. PMID 22915799 DOI:10.1128/JVI.00595-12
Ma J.-B., Ye K., Patel D.J. (2004). Structural basis for overhang-specific small interfering RNA recognition by the PAZ domain. Nature. 429: 318—322. PMID 15152257 DOI:10.1038/nature02519
Faehnle C.R., Elkayam E., Haase A.D., Hannon G.J., Joshua-Tor L. (2013). The making of a slicer: activation of human Argonaute-1. Cell Rep. 3: 1901—1909. PMID 23746446 DOI:10.1016/j.celrep.2013.05.033

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3262 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 28 серпня 2017. [Архівовано 2015-09-10 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q9UL18 (англ.) . Архів оригіналу за 26 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3262 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 28 серпня 2017. [Архівовано 2015-09-10 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, Q9UL18 (англ.) . Архів оригіналу за 26 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]