PROFILPELAJAR.COM

ABCF1
Ідентифікатори
Символи	ABCF1, ABC27, ABC50, ATP binding cassette subfamily F member 1
Зовнішні ІД	OMIM: 603429 MGI: 1351658 HomoloGene: 849 GeneCards: ABCF1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding; • ribosome binding; • translation activator activity; • translation factor activity, RNA binding; • ATPase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • ATP binding; • RNA binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • рибосома; • nuclear envelope; • мембрана; • нуклеоплазма; • клітинне ядро; • polysomal ribosome; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• Біосинтез білків; • ribosome biogenesis; • positive regulation of translation; • трансмембранний транспорт; • translational initiation; • inflammatory response;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	23
	224742
ENSG00000206490; ENSG00000225989; ENSG00000236149; ENSG00000232169; ENSG00000204574;
	ENSG00000236342; ENSG00000231129
	ENSMUSG00000038762
	Q8NE71
	Q6P542
	NM_001090; NM_001025091
	NM_013854
	NP_001020262; NP_001081
	NP_038882
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ABCF1 (англ. ATP binding cassette subfamily F member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 845 амінокислот, а молекулярна маса — 95 926^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPKAPKQQPP	EPEWIGDGES	TSPSDKVVKK	GKKDKKIKKT	FFEELAVEDK
QAGEEEKVLK	EKEQQQQQQQ	QQQKKKRDTR	KGRRKKDVDD	DGEEKELMER
LKKLSVPTSD	EEDEVPAPKP	RGGKKTKGGN	VFAALIQDQS	EEEEEEEKHP
PKPAKPEKNR	INKAVSEEQQ	PALKGKKGKE	EKSKGKAKPQ	NKFAALDNEE
EDKEEEIIKE	KEPPKQGKEK	AKKAEQGSEE	EGEGEEEEEE	GGESKADDPY
AHLSKKEKKK	LKKQMEYERQ	VASLKAANAA	ENDFSVSQAE	MSSRQAMLEN
ASDIKLEKFS	ISAHGKELFV	NADLYIVAGR	RYGLVGPNGK	GKTTLLKHIA
NRALSIPPNI	DVLLCEQEVV	ADETPAVQAV	LRADTKRLKL	LEEERRLQGQ
LEQGDDTAAE	RLEKVYEELR	ATGAAAAEAK	ARRILAGLGF	DPEMQNRPTQ
KFSGGWRMRV	SLARALFMEP	TLLMLDEPTN	HLDLNAVIWL	NNYLQGWRKT
LLIVSHDQGF	LDDVCTDIIH	LDAQRLHYYR	GNYMTFKKMY	QQKQKELLKQ
YEKQEKKLKE	LKAGGKSTKQ	AEKQTKEALT	RKQQKCRRKN	QDEESQEAPE
LLKRPKEYTV	RFTFPDPPPL	SPPVLGLHGV	TFGYQGQKPL	FKNLDFGIDM
DSRICIVGPN	GVGKSTLLLL	LTGKLTPTHG	EMRKNHRLKI	GFFNQQYAEQ
LRMEETPTEY	LQRGFNLPYQ	DARKCLGRFG	LESHAHTIQI	CKLSGGQKAR
VVFAELACRE	PDVLILDEPT	NNLDIESIDA	LGEAINEYKG	AVIVVSHDAR
LITETNCQLW	VVEEQSVSQI	DGDFEDYKRE	VLEALGEVMV	SRPRE

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Richard M., Drouin R., Beaulieu A.D. (1998). ABC50, a novel human ATP-binding cassette protein found in tumor necrosis factor-alpha-stimulated synoviocytes. Genomics. 53: 137—145. PMID 9790762 DOI:10.1006/geno.1998.5480
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Paytubi S., Morrice N.A., Boudeau J., Proud C.G. (2008). The N-terminal region of ABC50 interacts with eukaryotic initiation factor eIF2 and is a target for regulatory phosphorylation by CK2. Biochem. J. 409: 223—231. PMID 17894550 DOI:10.1042/BJ20070811

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:70 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 6 вересня 2017. [Архівовано 2015-09-10 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q8NE71 (англ.) . Архів оригіналу за 16 вересня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 6

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:70 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 6 вересня 2017. [Архівовано 2015-09-10 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, Q8NE71 (англ.) . Архів оригіналу за 16 вересня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]