Першим дорослим клубом гравця став «Удінезе», до складу якого Янкто приєднався у 2014, перейшовши туди із «Славії» за 700 тисяч євро[2]. Перший сезон Якуб провів у молодіжній команді, а в 2015 його перевели в основну команду.
Наступний сезон Якуб на правах оренди провів у клубі «Асколі», в якій провів один сезон, взявши участь у 34 матчах чемпіонату. Більшість часу, проведеного у складі «Асколі», був основним гравцем команди.
До складу клубу «Сампдорія» приєднався на правах оренди з опцією викупу за 15 млн євро 2018 року[3]. За сезон відіграв за генуезький клуб 25 матчів в національному чемпіонаті. Після закінчення сезону «Сампдорія» використала опцію викупу.
19 серпня 2021 року за 6 мільйонів євро (плюс можливі бонуси) перейшов до іспанського «Хетафе»[4]. У новій команді не зумів пробитися до основного складу і за півроку був відданий в оренду до празької «Спарти», у складі якої уперше за дорослу кар'єру пограв на батьківщині.
15 липня 2023 року повернувся до Італії, уклавши повноцінний дворічний контракт із «Кальярі».
У кінці грудня 2024 року зізнався у своїй нетрадиційній орієнтації, виклавши фото зі своїм коханим в соціальних мережах.
Виступи за збірні
2012 року дебютував у складі юнацької збірної Чехії, взяв участь у 15 іграх на юнацькому рівні, відзначившись 4 забитими голами.
Протягом 2015–2017 років залучався до складу молодіжної збірної Чехії. На молодіжному рівні зіграв в 11 офіційних матчах, забив 4 голи.