Ісіро Хонда народився 7 травня1911 року в Асахі, префектура Ямаґата, Японія в сім'ї буддистського священика. У Хонди було троє старших братів і одна сестра[1]. Після закінчення у 1931 році середньої школи в префектурі Канаґава, куди переїхала його сім'я, Хонда в числі першої групи студентів поступив на кафедру кіномистецтва новоствореного Університету Ніхон. Після закінчення університету у 1933 році він працював у відділі кіновиробництва P.C.L (Photo Chemical Laboratory), яка згодом стала студією Toho, виконуючи функції асистента режисера на низці японських кінофільмів. У 1935 році Хонда був призваний до армії, де прослужив майже вісім років. Брав участь у японсько-китайській війні, побував в полоні.
Після війни Ісіро Хонда у 1946 році повернувся на студію Toho. Працював асистентом режисера у Акіри Куросави на фільмі Безпритульний пес (1949). У 1951 році дебютував як самостійний режисер, поставивши фільм Рідкісна синя перлина (青珍珠).
У 1950-1960-і роки Хонда зняв декілька фільмів про Ґодзіллу, а також низку інших фантастичних стрічок про монстрів, що стали культовими. Хоча японські фільми про монстрів були висміяні деякими критиками, Хонда особливо пишався своїм внеском у цей досить унікальний аспект фентезійних і науково-фантастичних жанрів[2].
Після завершення режисерської кар'єри, Ісіро Хонда майже через 30 років повернувся до співпраці зі своїм старим другом і колишнім наставником Акірою Куросавою та працював як режисерський консультант, координатор виробничого процесу і творчий консультант на його останніх п'яти фільмах. Він також як режисер зняв один епізод у фільмі Куросави Сни (1990).
