Оміксні технології

Діаграма, що ілюструє геноміку
Діаграма, що ілюструє епігеноміку
Діаграма, що ілюструє епігеноміку

Оміксні технології — комплекс сучасних технологій в молекулярній біології та біоінформатиці, що включають геноміку, епігеноміку, транскриптоміку, протеоміку, метаболоміку, метагеноміку, інтерактоміку та інші.

Завдяки досягненням в біології, молекулярній генетиці та біоінформатиці і використанню оміксних технологій є можливим вивчати організм і його частини на різних рівнях, починаючи з найглибшого — рівня ДНК. Ці технології дають змогу виявити ті чи інші мутації в ДНК, з'ясувати, як вони впливають на експресію генів і продукування білків, а також — як ці білки взаємодіють між собою в подальшому[1][2][3].

Спрощена схема мультиомічної інтеграції оміксних даних кітини (без епігеноміки, епітранскриптоміки, метагеноміки та ін.)
Спрощена схема мультиомічної інтеграції оміксних даних кітини (без епігеному, епітранскриптому, метагеноміки та ін.)

Походження «-омікс» (англ. omics) в складі слова (поняття) — це англомовний омологічний неологізм, що неофіційно відноситься до галузі вивчення біології, що закінчується на -оміку, наприклад: геноміка, транскриптоміка, епігеноміка, епітранскриптоміка, протеоміка, метаболоміка, метагеноміка та інші.

Типи даних

Хронологія основних технологічних розробок і віх в різних аналізах оміксних технологій

Основні статті — Біоінформатика, Мультиоміка.

Оміксні технології
Сфера знань Сукупність Окремий елемент
епігеноміка епігеном Комплекс різних даних: сайти метилювання ДНК, модифікації гістонів, ремоделювання хроматину, некодуючі РНК
геноміка геном ген
транскриптоміка транскриптом транскрипт (мРНК)
протеоміка протеом білок
ліпідоміка ліпідом ліпід
глікоміка глікан полісахариди
метаболоміка метаболом метаболіт (продукт метаболізму)
інтерактоміка інтерактом взаємодія молекул
систеоміка[джерело?] структура впливу ланка передачі
флюксоміка флюксом каталізовані перетворення речовини та їх швидкість
сенсоміка сенсометаболом запах і смак
мікробіоміка: метагеноміка, метапротеоміка і т. д. дані геноміки, протеоміки та інших оміксних технологій в певних екосистемах (таких як певний мікробіом, як-от мікробіота кишки)
мультиоміка мультиом, паном Інтеграція даних всіх (або деяких) даних оміксних технологій разом

Інтеграція даних

Мультиоміка — підхід, який об'єднує дані багатьох оміксних технологій для інтегративного й повноцінного розуміння процесів в одній клітині[en], чи в певному середовищі, тканині чи ексосистемі.

Див. також

Додаткова література

Журнали

Примітки

  1. ↑ Omix Technologies. Omix Technologies (амер.). Архів оригіналу за 11 вересня 2019. Процитовано 28 квітня 2020.
  2. ↑ D’Alessandro, Angelo; Giardina, Bruno; Gevi, Federica; Timperio, Anna Maria; Zolla, Lello (2012-5). Clinical Metabolomics: the next stage of clinical biochemistry. Blood Transfusion. Т. 10, № Suppl 2. с. s19—s24. doi:10.2450/2012.005S. ISSN 1723-2007. PMC 3418628. PMID 22890264. Процитовано 28 квітня 2020.
  3. ↑ Ликбез. Омиксные технологии. Медпортал (рос.). Архів оригіналу за 22 жовтня 2020. Процитовано 28 квітня 2020.