Мото Гран-Прі Японії вперше відбулося у 1962 році. З 1963 по 1967 роки Гран-Прі входило у календар чемпіонату світу з шосейно-кільцевих мотогонокMotoGP як фінальна гонка сезону. У цей період змагання тричі відбувались на автомотодромі «Судзука» та ще двічі на «Фудзі Спідвей». Особливістю цих перших змагань було те, що тут не відбувались гонки в класах 500сс та Sidecar (гонки на мотоциклах з колясками).
У 1968 році в зв'язку з виходом з чемпіонату двох японських виробників мотоциклів, Honda і Suzuki, Гран-Прі Японії вилетіло з календаря чемпіонату світу.
MotoGP повернулося у Японію майже через два десятиліття, у 1987 році. Етап відбувався на «Судзуці» до 2003 року (окрім сезону 1999), коли у трагічній аварії загинув японський мотогонщик Дайджиро Като. З 2004 року Мото Гран-Прі Японії відбувається на автомотодромі «Твін Рінг Мотеґі». Цікаві, що на «Твін Рінг Мотеґі» у період з 2000 по 2003 роки відбувався інший етап чемпіонату MotoGP — Тихоокеанський Мото Гран-Прі.
У 2011 році багаторазовий чемпіон світу MotoGPВалентіно Россі разом з Кейсі Стоунером та Хорхе Лоренсо вирішили бойкотувати Гран-Прі Японії через аварію Фукусімській АЕС, яка розташована на відстані приблизно 120 км від Мотегі. Проте, під тиском зі сторони керівників японських виробників, змушені були «передумати» і замагання врешті відбулись.[1]
Переможці Гран-Прі Японії
Переможець мото Гран-Прі Японії 2009 року Хорхе Лоренцо
.svg){kind=small}
.svg){kind=small}
.svg){kind=small}
.svg){kind=small}
.svg){kind=small}
