Влітку 1997 року перейшов до одеського«Чорноморця». Дебютував за одеську команду 3 серпня 1997 року в переможному (5:0) домашньому поєдинку 5-го туру вищої ліги чемпіонату України проти запорізького«Торпедо». Марат вийшов на поле на 28-ій хвилині, замінивши Володимира Мусолітіна та відіграв увесь поєдинок, а на 45-ій хвилині отримав жовту картку[1]. У футболці «моряків» у чемпіонаті України зіграв 10 матчів, після чого у 1998 році повернувся до Росії.
У січні 2009 року перебував на перегляді в ФК «Нижній Новгород» і був близький до укладення контракту[2], проте в результаті не досяг згоди з клубом за його умовами і так і не був заявлений[3].