1 березня 2008 в результаті його об'єднання з Читинською областю було утворено Забайкальський край, у складі якого було проголошено створення адміністративно-територіальної одиниці з особливим статусом — Агінського Бурятського округу.
Адміністративний поділ
У складі округу з 2006 року існують 42 муніципальних утворення, з них 3 муніципальних райони (що збігаються з адміністративно-територіальними районами), 4 міських і 35 сільських поселення. У Агінському Бурятському окрузі немає міст, 4 селища міського типу, 35 сільських адміністрацій, всього 62 сільських населених пунктів.