İstanbul'da doğan Özer Kızıltan ilk, orta, lise öğrenimlerini İstanbul'da tamamladı. 1981'de İstanbul Üniversitesi Hukuk Fakültesine girdi. TV sektöründe senaristlik yapmaya başladı. Levent Kırca'nın Olacak O kadar programının yazarlarından biri oldu. 1989 yılında Mimar Sinan Üniversitesi Sinema-TV Bölümüne özel yetenek sınavıyla girdi.
Tiyatroyla da ilgilenen Kızıltan, Genç Oyuncular'ın Musahipzade Celal adlı oyununda rol aldı.
Öğrencilik döneminde Lütfi Akad, Sami Şekeroğlu, İlhan Arakon, Halit Refiğ, Duygu Sağıroğlu, Nedim Otyam gibi Türk sinemasının önemli ustalarından teorik ve uygulamalı dersler aldı. 1992-94 arasında TV yayını yapan İstanbul Büyükşehir Belediyesinin kanalı BRT'nin MSÜ Sinema-TV Merkezinden yaptığı yayınlarda görev aldı.
Öğrencilik döneminde çektiği “Gözlerin Yeşilçamın Son Yangını” adlı filmle, 1993 7. Adana Altın Koza Film Festivali Öğrenci Filmleri Yarışması'nda En İyi Film, En İyi Senaryo ödüllerini kazandı. Aynı filmle İzmir Kısa Film Festivali Altın Artemis Ödülü'nü ve T.C. Kültür Bakanlığı Başarı Ödülü'nü kazandı. 1991 yılında yazdığı “Değirmen” adlı senaryo ile Kültür Bakanlığı Senaryo Ödülü'nü aldı ve bu senaryoyu 35mm kısa film olarak çekti. 1992'de T.C. Kültür Bakanlığının açtığı senaryo yarışmasında “Welcome Missouri” adlı senaryosu ile ödül kazandı.
1993'te Prof. Sami Şekeroğlu danışmanlığında çektiği, Yaşar Kemal'in “Kuşlar da Gitti” adlı eserinden uyarladığı “Son Kuşlar da Gitti” adlı filmle lisans diplomasını aldı.
Mezuniyetinin ardından profesyonel alanda senarist, yönetmen ve danışman olarak çalışmaya devam etti. Sinema filmleri, TV dizileri, TV filmleri, tanıtım, eğitim ve reklam filmleri yönetti.