Nemuro alt prefektörlüğü (Japonca: 根室振興局 Nemuro-shinkō-kyoku), Japonya'nın Hokkaidō prefektörlüğüne bağlı bir alt prefektörlüktür. Yüzölçümü 3,406.23 km² olan alt prefektörlüğün nüfusu Mart 2009 tarihi itibarı ile 84,035'tir. Merkezi Nemuro şehridir.
Nemuro alt prefektörlüğü, bir şehir ile üç ilçeye (dört kasaba) ayrılmaktadır.
Japonya aynı zamanda günümüzde Rusya tarafından yönetilen Kuril Adaları'nın güney kısmını Nemuro alt prefektörlüğünün bir parçası olarak hak iddia etmektedir.
