Kulüp, 5 Mart 1904'te aynı zamanda ilk başkanı olacak Francisco Pantarotto tarafından "San Telmo Football Club" olarak kuruldu.[2] İlk merkezi Buenos Aires'in Paseo Colón Bulvarı'nda bulunuyordu. Kulübün, adını aldığı San Telmo bölgesindeki Juan de Garay caddesinde ilk stadyumunu inşa edene kadar Puerto Madero'da çeşitli mekânları vardı.
İlk formaları mavi ve beyazdı. Kulübün ilk resmî maçında yağan yağmur, formaların beyaz kısmını açık mavi tonunda kaplayacak kadar mavi rengin solmasına neden oldu. O andan itibaren kulüp, mavi ve açık maviyi resmî renkleri olarak benimsedi.
1916'da takım Arjantin Futbol Federasyonu'na üye oldu ve Segunda División de Ascenso turnuvasını kazandı. 1920'lerde kulüp, takımını bugüne kadar kalan "Club Atlético San Telmo" olarak değiştirdi. 1926'da satış tapusu olmaması nedeniyle San Telmo, Büyük Buenos Aires'in Dock Sud bölgesindeki Isla Maciel'e taşınmak zorunda kaldı. Kulüp 3 yıl sonra burada kendi stadyumunun açılışını yaptı. San Telmo'nun kazandığı ilk şampiyonluk 1949 Primera C'ydi ancak Arjantin lig sisteminin yeniden yapılandırılması nedeniyle kadro bir üst lige yükselemedi.
1975'te San Telmo Primera B'de 3. oldu, bu nedenle takım play-off oynamaya hak kazanarak nihayet Primera División'a yükselmeyi başardı. San Telmo 1. lige yükselmesine rağmen gelecek sezon küme düşecekti. Yine de 1976'da en üst ligde oynayan takım, 25 Mayıs 1976'da Huracán'ın stadında Boca Juniors'ı 3-1 yenerek kulüp tarihine unutulmaz bir sayfa yazdı.
6 yıl kapalı kaldıktan sonra stadyum, Ekim 2011'de Almagro ile 0-0 sona eren maça ev sahipliği yapmak üzere yeniden açıldı.[3]
Oyuncular
Mevcut kadro
31 Temmuz 2022 itibarıyla[5]
Not: Uyruk bilgisi futbolcuların FIFA uygunluk kurallarınca oynayabileceği millî takımı gösterir. FIFA kuralları haricinde başkaca uyruğa da sahip olabilirler.
Not: Uyruk bilgisi futbolcuların FIFA uygunluk kurallarınca oynayabileceği millî takımı gösterir. FIFA kuralları haricinde başkaca uyruğa da sahip olabilirler.