Enligt beslut den 22 juni 1883 skulle Skönsmon utbrytas ur Sköns församling. Den nya kapellförsamlingen skulle ha egen kyrkostämma, kyrkoråd och skolråd och utbrytningen skulle träda i kraft då kyrka blivit byggd. Den 6 oktober 1889 invigdes Skönsmons kyrka.[2] Enligt beslut den 11 december 1891 upphävdes utbrytningen. Den 26 april 1905 beslutades det dock att Skönsmon skulle återfå sin rätt som kapellförsamling.[3]
Församlingen var i den första perioden annexförsamling (som kapellförsamling) i pastoratet Skön, Alnö, Timrå och Skönsmon. Efter den andra utbrytningen 1905 till 1948 var församlingen annexförsamling (som kapellförsamling) i pastoratet Skön och Skönsmon. Från 1948 annexförsamling i pastoratet Sundsvall (namnändrad 1955 till Sundsvalls Gustav Adolf) och Skönsmon.[4] Församlingen uppgick 2015 i Sundsvalls församling.[5]
Församlingen omfattade i huvudsak sydöstra delen av tätorten Sundsvall, stadsdelarna Kubikenborg, Skönsmon och Östermalm. Även Fläsian och ön Tjuvholmen ligger inom Skönsmons församling.
^ [ab] Medlemmar i Svenska kyrkan i förhållande till folkmängd den 31.12.2014 per församling, kommun och län samt riket, Svenska kyrkan, läs online.[källa från Wikidata]