Organisationen, liksom tekniken den arbetar med, härrör från de insatser som utfördes under flera decennier av Hyman Rickover, från senare delen av 1940-talet och fram till dennes pensionering på 1980-talet.[3] Tidigare har även ett fåtal kryssare haft atomdrift, men dessa är numera inte längre i tjänst.[4][2]
Under 1990-talet skedde även en konsolidering av utbildningsverksamheten och från 1998 är Naval Nuclear Power Training Command (NNPTC) med dess Nuclear Power School samt Nuclear Power Training Unit förlagd vid Joint Base Charleston. Utbildningen inom flottans atomreaktorprogram anses vara den mest akademiskt krävande i USA:s väpnade styrkor.[7]
I Nuclear Power Training Unit ingår två utrangerade förtöjda atomubåtar som används i utbildningssyfte för kärnreaktordrift. Det pågår ett generationsskifte med två äldre atomubåtar av Lafayette-klass och James Madison-klass som successivt ersätts av två atomubåtar i Los Angeles-klass.[8]