Lena Endre föddes som dotter till jazzmusikern och försäljaren Gerhard "Gejje" Kjellson (1926–2016) och kartriterskan Beryl Forsman (1932–2007). Föräldrarna gick tidigt skilda vägar. Lena Endre fick i stället namnet Endre efter moderns nye make, arkitekten Ants Endre (född i Estland 1939), som adopterade henne.[5][6] Släkten Kjellson har innehaft Hovmantorps säteri i Småland sedan 1856.[6]
Endre växte delvis upp i sin mors hemtrakter i Härnösand, Ångermanland och delvis i Trollbäcken i Tyresö i Stockholms län. Hon började att studera marinbiologi, men hoppade av studierna och började istället att arbeta i en skivaffär. Parallellt med detta gick hon med i amatörteatergruppen Teater Bellamkåm 1979 och Inge Waerns teaterstudio 1979–1980.[4]
Tre år senare, 1983, kom hon in på scenskolan i Stockholm. Hon gjorde också sin första filmroll i Slagskämpen (1984). Hon gjorde sin praktik i Malmö och utexaminerades 1986. 1987–1988 medverkade hon i TV-serien Varuhuset, i rollen som Ingrid Persson. Rollen kom att bli hennes genombrott.[4]
1987 kom hon till Dramaten i Stockholm via Ingmar Bergman. Bergman hade upptäckt Endre när hon medverkade i Varuhuset, där hon enligt Bergman var "oavbrutet levande i varje ton".[4] Sedan sin debut på Dramaten har Endre gjort ett tjugotal roller.[7] Hösten 2015 medverkade hon i Eirik Stubös uppsättning av Och ge oss skuggorna[8].
Åren 1979–1981 var hon gift med Malte Ekblom och 1982–1985 med Vjeko Benzon. 1986–1999 levde hon tillsammans med Thomas Hanzon, med vilken hon har barnen Rosanna (född 1990) och Edvin Endre (1994),[13] vilka också gett sig in på skådespelarbanan.[14][15][16]